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from collections import defaultdict
import sys
from typing import Iterable, List
import pytest
from lib import *
from util import *
import constants
def string_composition(s: str, k: int):
return [s[i:i+k] for i in range(len(s)-k+1)]
def kmer_path_to_string(path: Iterable[str]):
s = [path[0]]
for comp in path[1:]:
s.append(comp[-1])
print(s[0:10])
print(''.join(s[0:10]))
return ''.join(s)
def overlap_graph(reads: Iterable[str]):
n = len(reads[0])
nodes = defaultdict(list)
for read in reads:
suffix = read[1:]
for read2 in reads:
if read2[0:n-1] == suffix:
nodes[read].append(read2)
return nodes
def de_bruijn_graph_from_string(s: str, k: int):
kmers = string_composition(s, k)
nodes = defaultdict(list)
for kmer in kmers:
prefix = kmer[:k-1]
suffix = kmer[1:]
nodes[prefix].append(suffix)
return nodes
def de_bruijn_graph_from_kmers(kmers: List[str], k: int = None):
if not k:
k = len(kmers[0])
nodes = defaultdict(list)
for kmer in kmers:
prefix = kmer[0:k-1]
suffix = kmer[1:]
nodes[prefix].append(suffix)
return nodes
def test_week1():
print()
print_sep("Bioinformatics II: Week 1 - How do we assemble genomes?")
print_sep("String Composition")
print("""Solve the String Composition Problem.
Input: An integer k and a string Text.
Output: Compositionk(Text) (the k-mers can be provided in any order).
""")
test_string_composition()
input = ('ACACTTAGGACCTATACCTCCTCTAACCCAGAGCACACTCGGCAAATCCAGCACGAACCGAAGTAGGTGAAACTCCTAGCCGCTCTACTTGTTAATTCGGCAGACGACCTGAGTCGCGGACAAGGCACCACTCTCCAAGATGATCGCCTGGTGAAGCGGCCATCCCTTTCGACTTTCGAATTTTACAGTCGAGTCCCCGTTTTTTTGTGATCTCCCTTTGTATCACACGGTGATTGTTCGTTAATTGTAGCATGGTGACTTAAGTGACGGGATTAGCGAACGACATATCTACAATAGACCGTCATTCACTAGCGGAGAACCGAACCTGCATACAGGAGCCATGTTTCACTTGTCTGCACATCCCATCGCTTGGGGCGGTCAGTGCAGTATCTGCCCTCGTTCCGTTAGTTTTAGTCACATTGTATCACCAACCACTTCTCGTAACTCGATCGAGCTTACACACCTCAGCTCTGAGGATGCAAAAAACGCCGGGATTTTGTCACGTCCATAAGCTTGGGCTTGCCCCCCATGACAAAACACAACCGCCACAACTGCTATGTGGAATCGGAGGGGAGCAAAGCGAAACTATTCTTTTGGATTGGAGCTCGCCAGGCGTTATAGTGGGACTCCGGCGAAATTCCGCTAATTGCTCCCCACGATCGTTGTGTGTAAAGTGTCGAGGGACGCCGATTGCCCAATTAAGGCGCCCTAGGCCGGTAATATCGACAATGCTAGGGAGGTCCATCATTTATGGACAGGGCCGCATGTTTGGGGGGATCGACTTATTGCTGGTGCTCACACAAGCTTTCGGTGCGATAGAGCTATCCGGCGTGATGCTCAGGAATTTCTCCCCATCGCGTACAACACTGCGAGGTTCGGGGTAGAAACCTAAATTGGTGCTACAATACTAAAATAAGGCTTGCATGTTTCCTGCAAAGGGAGCCTGAGGCTCTAGTTTGGATCCGTGAACCAGCCGGGCTGGTGGCGGGGGTTCGCAGTGAGTGCTTCTGCCCGTACGAAACCGTCGTTTGTGAGCCAGAGAGTCCAGGTACTGCATGAAATTAAGACTTAGGCGGATCCATATTAGGTGGGCATCAACTTTTATGATAGCGAATCATGGCGGTGGTGCATTACCATTTTGGAGGTAGGGAAGGAGCTCCGGCTTAGGCCTTACTGTAAGAATATACCGCTATATCGGTTTCTACAAAAGACACAACACCGTGTCGTAAAATGTTTCACATTATAGCTGTGAACGTATCTCCCGGCACACTCAATAATAGGGCGCCAGATGATGCACATTATACTGCATTAGCTAACACTGAAGATCTCATACGGCTTCGGACAGGGGAGGCCTCTGGATTCGGGGACTATCTTCTGGCACGGAAACAGTGTCACTCAACTTATGCAAGGATCAGATGTCTCCAAGGGTCCGGAGATGTGAGTCTAAGCGTCTAATACCTCAGGCGGGGCGTAGGCCTCAAGTGATTCTGGCACTCATGTCTTTCGCTTGGTCCCAACCACTCATTAAAGCTATGGCGCGTAAGGCTGCGGTCCCAAGCGGTTTACACACTACTTTGCGTAGGCAATACAACAAGAGATCTCTCCTTACAGCTCCAGCGTGAACTATCCGAAACGTCGAGATCCATTAACTCACGCATGAGGGCGGAAACCTAGGTCTTTGAATGCCGATCCGCGCGTACATCCGGCGATAACGACCTGTTATTTGAAATAAAGTCCTGGAGGCTATAATGAACTCAGGATAAGGGAGTCCATATGAGGCTGGGAGTGACCCGCAAATGACGACCAATGGGGCTCGAACTCCACGCTTACATTCCCCGCTTGAGACAATCCATGAAATTTCCATAGGAGTTGTGCTGTACAGCCGTTACTCGTCCCACTAGTGAAACATTCAACCGGGACCTGGTTCCTTTATAACACTCAATTCTACACGTGGAATGCCACGTCTTCAGACCGCCCTGCAATATCATTGTAGCTAAATTGTTTTAGGTTTATGGCTAGCACACTTTGGAGGTTTTACGTAGAACGGATTTAGTTACCGGTTCCGCGATCGAGGTCAAAGTCATTTCAAATCAATTCCCTTAGGGAGCCGATACCCCTTTTTGTCCGACCACGTGGACTTGGTTCGGGGGGATCGCTACTACACGCCCCTAGGGCAAAAACTGTCTTCGGCAGCGGGACCGGAACATCCGTATACACACACCTGTTGTACTCCAGCTGCACCCGTGCAGGAATTCTGGTTCCTTTATCGCAGATGGGGGATCTCGGATTGACGCTGTTTCTGCCAGTCGTCTAGAGTTATCCACAATCGCCATCAGTCTGTGTGGCAGGGAAACTTGGTTTTGTGCTCTAGACATATCTGCACCGATTCGAATTATTCCGGGCACCTATAGATAATGGCGCCTAACAAGGGATTAATCCGCGTCACAGCGAATGGCCCAGTAGGCGAATTAAGCCTGCGGTCCTTGGCTCTGTCGAGGTATATTGGAATGGACCAAACTTTGGTTATGCTTTGGACAGCATGAGAGCAATTATAAGTAAAACAGATCTCCAGCTGACTGGCGCTGGATTACAAAACTGTACGATCTCTCATAGGCCGACCCTACGTCAGACTCCGGAGTCTTCGCCTTACTCATTCGCAACCGAGGCCTTTCCGCGTTTGAGTCGTCGACCTGGCCCCAGAGTCTCCGCATCGATCTAGCCCCGACCAAATGAGGCCGCATACGTAGAAGAGATTAGTTAGGAAACATCTGCACTCTGAACAATGGTCGGGTTCGTTTTCCTTATTCTCGTTCCGCTACTCTGCTTGTATCCGAGGGAGCCATTTTAAAGTATATACGTAGATGGTTTCTAAGCAATTCAGTCCTGTTTGTCGAGGCATACATTTCGAAAGTACACTGGGGGGCCCATGCTATGATCGAGCCTGTGCTCGCTTTCCGCTGAGAAGCAAACGACCTATTGGTTGCATTCGCTCACATCATCTGCCATCTCCCGATCTCGATAATGCGAATTATTACCAATGCTCTGGCATCGCCATGCGCACCTTACACCCTCTTTCAGGAAGGTCTAGGTTTAGCTTCGCCGATCTCCCTGCCCCTCGTATCAGCGTGAAAACCACGCGACATTAACCCAACACTGGCGCGCAGGCTCTAAGCGAACAAATCATCTGAAAATTACCTACTTTTGGTCCGACAGTAGGACGAGAATCTCGCCGACTGTCGACCGGTGGGAATTGGTTCGGAATGAATTCACATAACCGCGGGAAAGCGCATCATTCTCCCTGTACCCGCTCTCAAACCCAGGAATCATTCACTCTGGGTCTTCGTATGATTCGGTGAATCTGCGGGTTCCCGTGCGCACTTTCACGACCCTTAAAGTTTGGACGTCTTGGAGGGTGCGTCGAAATGAGTATATAGACATGTCAATCGTTACCAACCTGTGCGGAAATTAGCTGGCTCTTAGCCTTGACCCGCTCCTCTACCCTCGTAAAAGGTTACGGGTTCTGTAACAACGTACACTAGGCATCGACAGCCCAGATAACTTGGGGTAGACGTGCTATTGTGTTGCGTAGGTTCCCTGCCCGGTTTCTTTGAATATCGAAGTTGCCGATTTCTAGCCGCGGCGGTCGAAAGATCCTCTGCGGACCTCTAAACAAACATAAAAGACACGTCGGCAATTCCGAAAGTGATCTTATGCCAAACGGCTCTAATCGGGCGCGACGGCCAGGCCCAGTCGGCGCCGATTAAGAGCTCTATATAGCCTGGCAACCACTGATTACTTGGGATTGTATGAGCCCCAACTGGACATAGTGCGGCTAATATCCGAACCGGTGTGGAGACTGTAGTGGGCGTAAAGTGCCGAGGTTTAGCGTAGGTTCTAAGAGGCTCTCATCGCGTGAGCAGCCAGAACAGGGTAAAAAGAGCGTTACTGAGCATTCACCTCAGCTTGATTCATAATTATCGTGCGAACCCTACACCGCTTATCGGATTTACCATCGATCTGACGTTAGTATCCAACATAGTTGTGATTTAAAGGAATTACGCAGGAGCTCGTGCCGTATCTAGACTATGTCATATGCGGAGCTCCTCCAGCCGTTGCAATATCGTCTTCGATGCGCTTTCGTCATTGGCGAACCTACATTTTAAATCCCGGAACGCCGTGTATACCCCCGAACGTTAAGCGCTCTCACTCGGTGACTTGGTTTCAATTACGCGTAGTCTGGACCCCCATTGAGGTGGGCTCCCCAAATTTCCAAGTCCACTAGCTTGTGTAAAAATTTGAGACCAGTGGTGTACGCCCCAGAGCTTTGCATAGCAGCAAGCCAGGGTGGTGACAACGCGTCTATAATGAAGCACTAGGTGGGAGGCCGGTAAGCTTCAACGGTGAGCGCTACCGATCCAGACCCCGTGCCGAATGGAGTACGCACACCGGTCGGTATACTCTAATGACACTCCAAGCCTTGAATGAAAACTTTAGACTAATGAAGTCGGATCGTGACTGTGCTGAATATTACGTCTGCAATAGGGACTCCGCGAACATAAAGGCACAAGTTACAACGAAGCAAAACTTCCACGCGATTTGCCAGGTGGAGAGCAACGCACTCAATACAAACAGAACTATCGCCATATATTCTGGCGAATCCGCTACCCAAAACATTCGAATAATTTTAGTGTAACCGGTGGCCGTTACTTGCCATTATGTCACACAACAGCCTCAAAGCCTGTAAAGATAAGCCTCAACGTTGATTCCGTAGAAAGAGTATAGTAAGAGTGAAACCATCAGCGGCACGGATGGCCCACACTTTGGTTATTTGTTGTCCGAGTCGCTAACGCTCGACCTTGTTCCTCGGCAACGAAAGACGCCCGTGCGCTCTCGTGTAGGGGGCTGACCATGTAATGTAATGACAGAGTCAGCGGGGACTTGACAGTAAGGTAAGTAGTCTATCAGCTCAGGCCCATATATTACAGGTTTCCTTTACTCCT', 100)
write_temp(string_composition(*input))
print_sep("String Spelled by a Genome Path")
test_kmer_path_to_string()
input = (['CTGCGATAGCCCGGTACAGTTACCA','TGCGATAGCCCGGTACAGTTACCAT','GCGATAGCCCGGTACAGTTACCATT','CGATAGCCCGGTACAGTTACCATTG','GATAGCCCGGTACAGTTACCATTGT','ATAGCCCGGTACAGTTACCATTGTT','TAGCCCGGTACAGTTACCATTGTTG','AGCCCGGTACAGTTACCATTGTTGG','GCCCGGTACAGTTACCATTGTTGGA','CCCGGTACAGTTACCATTGTTGGAC','CCGGTACAGTTACCATTGTTGGACG','CGGTACAGTTACCATTGTTGGACGC','GGTACAGTTACCATTGTTGGACGCG','GTACAGTTACCATTGTTGGACGCGG','TACAGTTACCATTGTTGGACGCGGG','ACAGTTACCATTGTTGGACGCGGGC','CAGTTACCATTGTTGGACGCGGGCA','AGTTACCATTGTTGGACGCGGGCAC','GTTACCATTGTTGGACGCGGGCACA','TTACCATTGTTGGACGCGGGCACAG','TACCATTGTTGGACGCGGGCACAGC','ACCATTGTTGGACGCGGGCACAGCC','CCATTGTTGGACGCGGGCACAGCCG','CATTGTTGGACGCGGGCACAGCCGC','ATTGTTGGACGCGGGCACAGCCGCG','TTGTTGGACGCGGGCACAGCCGCGG','TGTTGGACGCGGGCACAGCCGCGGA','GTTGGACGCGGGCACAGCCGCGGAC','TTGGACGCGGGCACAGCCGCGGACG','TGGACGCGGGCACAGCCGCGGACGG','GGACGCGGGCACAGCCGCGGACGGA','GACGCGGGCACAGCCGCGGACGGAC','ACGCGGGCACAGCCGCGGACGGACA','CGCGGGCACAGCCGCGGACGGACAG','GCGGGCACAGCCGCGGACGGACAGC','CGGGCACAGCCGCGGACGGACAGCG','GGGCACAGCCGCGGACGGACAGCGT','GGCACAGCCGCGGACGGACAGCGTC','GCACAGCCGCGGACGGACAGCGTCT','CACAGCCGCGGACGGACAGCGTCTG','ACAGCCGCGGACGGACAGCGTCTGG','CAGCCGCGGACGGACAGCGTCTGGA','AGCCGCGGACGGACAGCGTCTGGAC','GCCGCGGACGGACAGCGTCTGGACT','CCGCGGACGGACAGCGTCTGGACTA','CGCGGACGGACAGCGTCTGGACTAT','GCGGACGGACAGCGTCTGGACTATA','CGGACGGACAGCGTCTGGACTATAC','GGACGGACAGCGTCTGGACTATACC','GACGGACAGCGTCTGGACTATACCA','ACGGACAGCGTCTGGACTATACCAA','CGGACAGCGTCTGGACTATACCAAG','GGACAGCGTCTGGACTATACCAAGA','GACAGCGTCTGGACTATACCAAGAC','ACAGCGTCTGGACTATACCAAGACT','CAGCGTCTGGACTATACCAAGACTC','AGCGTCTGGACTATACCAAGACTCA','GCGTCTGGACTATACCAAGACTCAC','CGTCTGGACTATACCAAGACTCACT','GTCTGGACTATACCAAGACTCACTG','TCTGGACTATACCAAGACTCACTGC','CTGGACTATACCAAGACTCACTGCT','TGGACTATACCAAGACTCACTGCTC','GGACTATACCAAGACTCACTGCTCT','GACTATACCAAGACTCACTGCTCTT','ACTATACCAAGACTCACTGCTCTTA','CTATACCAAGACTCACTGCTCTTAG','TATACCAAGACTCACTGCTCTTAGC','ATACCAAGACTCACTGCTCTTAGCT','TACCAAGACTCACTGCTCTTAGCTG','ACCAAGACTCACTGCTCTTAGCTGC','CCAAGACTCACTGCTCTTAGCTGCT','CAAGACTCACTGCTCTTAGCTGCTT','AAGACTCACTGCTCTTAGCTGCTTC','AGACTCACTGCTCTTAGCTGCTTCT','GACTCACTGCTCTTAGCTGCTTCTG','ACTCACTGCTCTTAGCTGCTTCTGT','CTCACTGCTCTTAGCTGCTTCTGTA','TCACTGCTCTTAGCTGCTTCTGTAT','CACTGCTCTTAGCTGCTTCTGTATC','ACTGCTCTTAGCTGCTTCTGTATCG','CTGCTCTTAGCTGCTTCTGTATCGC','TGCTCTTAGCTGCTTCTGTATCGCT','GCTCTTAGCTGCTTCTGTATCGCTA','CTCTTAGCTGCTTCTGTATCGCTAA','TCTTAGCTGCTTCTGTATCGCTAAA','CTTAGCTGCTTCTGTATCGCTAAAG','TTAGCTGCTTCTGTATCGCTAAAGT','TAGCTGCTTCTGTATCGCTAAAGTA','AGCTGCTTCTGTATCGCTAAAGTAC','GCTGCTTCTGTATCGCTAAAGTACC','CTGCTTCTGTATCGCTAAAGTACCT','TGCTTCTGTATCGCTAAAGTACCTT','GCTTCTGTATCGCTAAAGTACCTTA','CTTCTGTATCGCTAAAGTACCTTAC','TTCTGTATCGCTAAAGTACCTTACC','TCTGTATCGCTAAAGTACCTTACCG','CTGTATCGCTAAAGTACCTTACCGT','TGTATCGCTAAAGTACCTTACCGTT','GTATCGCTAAAGTACCTTACCGTTG','TATCGCTAAAGTACCTTACCGTTGG','ATCGCTAAAGTACCTTACCGTTGGC','TCGCTAAAGTACCTTACCGTTGGCA','CGCTAAAGTACCTTACCGTTGGCAG','GCTAAAGTACCTTACCGTTGGCAGA','CTAAAGTACCTTACCGTTGGCAGAC','TAAAGTACCTTACCGTTGGCAGACA','AAAGTACCTTACCGTTGGCAGACAA','AAGTACCTTACCGTTGGCAGACAAC','AGTACCTTACCGTTGGCAGACAACA','GTACCTTACCGTTGGCAGACAACAC','TACCTTACCGTTGGCAGACAACACT','ACCTTACCGTTGGCAGACAACACTG','CCTTACCGTTGGCAGACAACACTGT','CTTACCGTTGGCAGACAACACTGTA','TTACCGTTGGCAGACAACACTGTAC','TACCGTTGGCAGACAACACTGTACG','ACCGTTGGCAGACAACACTGTACGT','CCGTTGGCAGACAACACTGTACGTG','CGTTGGCAGACAACACTGTACGTGT','GTTGGCAGACAACACTGTACGTGTT','TTGGCAGACAACACTGTACGTGTTA','TGGCAGACAACACTGTACGTGTTAT','GGCAGACAACACTGTACGTGTTATA','GCAGACAACACTGTACGTGTTATAA','CAGACAACACTGTACGTGTTATAAC','AGACAACACTGTACGTGTTATAACA','GACAACACTGTACGTGTTATAACAT','ACAACACTGTACGTGTTATAACATA','CAACACTGTACGTGTTATAACATAC','AACACTGTACGTGTTATAACATACC','ACACTGTACGTGTTATAACATACCA','CACTGTACGTGTTATAACATACCAG','ACTGTACGTGTTATAACATACCAGG','CTGTACGTGTTATAACATACCAGGA','TGTACGTGTTATAACATACCAGGAC','GTACGTGTTATAACATACCAGGACC','TACGTGTTATAACATACCAGGACCT','ACGTGTTATAACATACCAGGACCTA','CGTGTTATAACATACCAGGACCTAC','GTGTTATAACATACCAGGACCTACT','TGTTATAACATACCAGGACCTACTG','GTTATAACATACCAGGACCTACTGA','TTATAACATACCAGGACCTACTGAG','TATAACATACCAGGACCTACTGAGC','ATAACATACCAGGACCTACTGAGCA','TAACATACCAGGACCTACTGAGCAA','AACATACCAGGACCTACTGAGCAAT','ACATACCAGGACCTACTGAGCAATA','CATACCAGGACCTACTGAGCAATAT','ATACCAGGACCTACTGAGCAATATC','TACCAGGACCTACTGAGCAATATCA','ACCAGGACCTACTGAGCAATATCAA','CCAGGACCTACTGAGCAATATCAAG','CAGGACCTACTGAGCAATATCAAGA','AGGACCTACTGAGCAATATCAAGAC','GGACCTACTGAGCAATATCAAGACA','GACCTACTGAGCAATATCAAGACAT','ACCTACTGAGCAATATCAAGACATG','CCTACTGAGCAATATCAAGACATGG','CTACTGAGCAATATCAAGACATGGG','TACTGAGCAATATCAAGACATGGGG','ACTGAGCAATATCAAGACATGGGGT','CTGAGCAATATCAAGACATGGGGTT','TGAGCAATATCAAGACATGGGGTTT','GAGCAATATCAAGACATGGGGTTTG','AGCAATATCAAGACATGGGGTTTGG','GCAATATCAAGACATGGGGTTTGGA','CAATATCAAGACATGGGGTTTGGAG','AATATCAAGACATGGGGTTTGGAGT','ATATCAAGACATGGGGTTTGGAGTC','TATCAAGACATGGGGTTTGGAGTCT','ATCAAGACATGGGGTTTGGAGTCTG','TCAAGACATGGGGTTTGGAGTCTGT','CAAGACATGGGGTTTGGAGTCTGTC','AAGACATGGGGTTTGGAGTCTGTCC','AGACATGGGGTTTGGAGTCTGTCCT','GACATGGGGTTTGGAGTCTGTCCTT','ACATGGGGTTTGGAGTCTGTCCTTC','CATGGGGTTTGGAGTCTGTCCTTCC','ATGGGGTTTGGAGTCTGTCCTTCCA','TGGGGTTTGGAGTCTGTCCTTCCAG','GGGGTTTGGAGTCTGTCCTTCCAGT','GGGTTTGGAGTCTGTCCTTCCAGTA','GGTTTGGAGTCTGTCCTTCCAGTAC','GTTTGGAGTCTGTCCTTCCAGTACG','TTTGGAGTCTGTCCTTCCAGTACGT','TTGGAGTCTGTCCTTCCAGTACGTC','TGGAGTCTGTCCTTCCAGTACGTCC','GGAGTCTGTCCTTCCAGTACGTCCC','GAGTCTGTCCTTCCAGTACGTCCCA','AGTCTGTCCTTCCAGTACGTCCCAA','GTCTGTCCTTCCAGTACGTCCCAAT','TCTGTCCTTCCAGTACGTCCCAATT','CTGTCCTTCCAGTACGTCCCAATTC','TGTCCTTCCAGTACGTCCCAATTCA','GTCCTTCCAGTACGTCCCAATTCAA','TCCTTCCAGTACGTCCCAATTCAAA','CCTTCCAGTACGTCCCAATTCAAAT','CTTCCAGTACGTCCCAATTCAAATG','TTCCAGTACGTCCCAATTCAAATGA','TCCAGTACGTCCCAATTCAAATGAT','CCAGTACGTCCCAATTCAAATGATA','CAGTACGTCCCAATTCAAATGATAG','AGTACGTCCCAATTCAAATGATAGC','GTACGTCCCAATTCAAATGATAGCA','TACGTCCCAATTCAAATGATAGCAA','ACGTCCCAATTCAAATGATAGCAAA','CGTCCCAATTCAAATGATAGCAAAG','GTCCCAATTCAAATGATAGCAAAGG','TCCCAATTCAAATGATAGCAAAGGC','CCCAATTCAAATGATAGCAAAGGCG','CCAATTCAAATGATAGCAAAGGCGC','CAATTCAAATGATAGCAAAGGCGCG','AATTCAAATGATAGCAAAGGCGCGC','ATTCAAATGATAGCAAAGGCGCGCT','TTCAAATGATAGCAAAGGCGCGCTA','TCAAATGATAGCAAAGGCGCGCTAA','CAAATGATAGCAAAGGCGCGCTAAC','AAATGATAGCAAAGGCGCGCTAACA','AATGATAGCAAAGGCGCGCTAACAC','ATGATAGCAAAGGCGCGCTAACACT','TGATAGCAAAGGCGCGCTAACACTT','GATAGCAAAGGCGCGCTAACACTTG','ATAGCAAAGGCGCGCTAACACTTGA','TAGCAAAGGCGCGCTAACACTTGAC','AGCAAAGGCGCGCTAACACTTGACC','GCAAAGGCGCGCTAACACTTGACCC','CAAAGGCGCGCTAACACTTGACCCT','AAAGGCGCGCTAACACTTGACCCTG','AAGGCGCGCTAACACTTGACCCTGA','AGGCGCGCTAACACTTGACCCTGAG','GGCGCGCTAACACTTGACCCTGAGG','GCGCGCTAACACTTGACCCTGAGGA','CGCGCTAACACTTGACCCTGAGGAC','GCGCTAACACTTGACCCTGAGGACA','CGCTAACACTTGACCCTGAGGACAT','GCTAACACTTGACCCTGAGGACATG','CTAACACTTGACCCTGAGGACATGC','TAACACTTGACCCTGAGGACATGCC','AACACTTGACCCTGAGGACATGCCT','ACACTTGACCCTGAGGACATGCCTT','CACTTGACCCTGAGGACATGCCTTA','ACTTGACCCTGAGGACATGCCTTAA','CTTGACCCTGAGGACATGCCTTAAG','TTGACCCTGAGGACATGCCTTAAGT','TGACCCTGAGGACATGCCTTAAGTT','GACCCTGAGGACATGCCTTAAGTTC','ACCCTGAGGACATGCCTTAAGTTCC','CCCTGAGGACATGCCTTAAGTTCCA','CCTGAGGACATGCCTTAAGTTCCAG','CTGAGGACATGCCTTAAGTTCCAGC','TGAGGACATGCCTTAAGTTCCAGCA','GAGGACATGCCTTAAGTTCCAGCAG','AGGACATGCCTTAAGTTCCAGCAGT','GGACATGCCTTAAGTTCCAGCAGTT','GACATGCCTTAAGTTCCAGCAGTTG','ACATGCCTTAAGTTCCAGCAGTTGA','CATGCCTTAAGTTCCAGCAGTTGAT','ATGCCTTAAGTTCCAGCAGTTGATG','TGCCTTAAGTTCCAGCAGTTGATGG','GCCTTAAGTTCCAGCAGTTGATGGC','CCTTAAGTTCCAGCAGTTGATGGCT','CTTAAGTTCCAGCAGTTGATGGCTT','TTAAGTTCCAGCAGTTGATGGCTTT','TAAGTTCCAGCAGTTGATGGCTTTC','AAGTTCCAGCAGTTGATGGCTTTCA','AGTTCCAGCAGTTGATGGCTTTCAG','GTTCCAGCAGTTGATGGCTTTCAGA','TTCCAGCAGTTGATGGCTTTCAGAT','TCCAGCAGTTGATGGCTTTCAGATA','CCAGCAGTTGATGGCTTTCAGATAC','CAGCAGTTGATGGCTTTCAGATACA','AGCAGTTGATGGCTTTCAGATACAG','GCAGTTGATGGCTTTCAGATACAGG','CAGTTGATGGCTTTCAGATACAGGG','AGTTGATGGCTTTCAGATACAGGGG','GTTGATGGCTTTCAGATACAGGGGC','TTGATGGCTTTCAGATACAGGGGCG','TGATGGCTTTCAGATACAGGGGCGC','GATGGCTTTCAGATACAGGGGCGCA','ATGGCTTTCAGATACAGGGGCGCAT','TGGCTTTCAGATACAGGGGCGCATG','GGCTTTCAGATACAGGGGCGCATGC','GCTTTCAGATACAGGGGCGCATGCA','CTTTCAGATACAGGGGCGCATGCAG','TTTCAGATACAGGGGCGCATGCAGT','TTCAGATACAGGGGCGCATGCAGTC','TCAGATACAGGGGCGCATGCAGTCA','CAGATACAGGGGCGCATGCAGTCAG','AGATACAGGGGCGCATGCAGTCAGA','GATACAGGGGCGCATGCAGTCAGAA','ATACAGGGGCGCATGCAGTCAGAAA','TACAGGGGCGCATGCAGTCAGAAAT','ACAGGGGCGCATGCAGTCAGAAATT','CAGGGGCGCATGCAGTCAGAAATTG','AGGGGCGCATGCAGTCAGAAATTGA','GGGGCGCATGCAGTCAGAAATTGAC','GGGCGCATGCAGTCAGAAATTGACC','GGCGCATGCAGTCAGAAATTGACCC','GCGCATGCAGTCAGAAATTGACCCG','CGCATGCAGTCAGAAATTGACCCGA','GCATGCAGTCAGAAATTGACCCGAG','CATGCAGTCAGAAATTGACCCGAGC','ATGCAGTCAGAAATTGACCCGAGCA','TGCAGTCAGAAATTGACCCGAGCAC','GCAGTCAGAAATTGACCCGAGCACA','CAGTCAGAAATTGACCCGAGCACAC','AGTCAGAAATTGACCCGAGCACACG','GTCAGAAATTGACCCGAGCACACGG','TCAGAAATTGACCCGAGCACACGGC','CAGAAATTGACCCGAGCACACGGCC','AGAAATTGACCCGAGCACACGGCCA','GAAATTGACCCGAGCACACGGCCAT','AAATTGACCCGAGCACACGGCCATA','AATTGACCCGAGCACACGGCCATAG','ATTGACCCGAGCACACGGCCATAGC','TTGACCCGAGCACACGGCCATAGCG','TGACCCGAGCACACGGCCATAGCGA','GACCCGAGCACACGGCCATAGCGAT','ACCCGAGCACACGGCCATAGCGATG','CCCGAGCACACGGCCATAGCGATGG','CCGAGCACACGGCCATAGCGATGGG','CGAGCACACGGCCATAGCGATGGGC','GAGCACACGGCCATAGCGATGGGCC','AGCACACGGCCATAGCGATGGGCCA','GCACACGGCCATAGCGATGGGCCAA','CACACGGCCATAGCGATGGGCCAAG','ACACGGCCATAGCGATGGGCCAAGT','CACGGCCATAGCGATGGGCCAAGTT','ACGGCCATAGCGATGGGCCAAGTTT','CGGCCATAGCGATGGGCCAAGTTTT','GGCCATAGCGATGGGCCAAGTTTTT','GCCATAGCGATGGGCCAAGTTTTTC','CCATAGCGATGGGCCAAGTTTTTCT','CATAGCGATGGGCCAAGTTTTTCTT','ATAGCGATGGGCCAAGTTTTTCTTT','TAGCGATGGGCCAAGTTTTTCTTTA','AGCGATGGGCCAAGTTTTTCTTTAA','GCGATGGGCCAAGTTTTTCTTTAAG','CGATGGGCCAAGTTTTTCTTTAAGT','GATGGGCCAAGTTTTTCTTTAAGTA','ATGGGCCAAGTTTTTCTTTAAGTAA','TGGGCCAAGTTTTTCTTTAAGTAAC','GGGCCAAGTTTTTCTTTAAGTAACC','GGCCAAGTTTTTCTTTAAGTAACCG','GCCAAGTTTTTCTTTAAGTAACCGG','CCAAGTTTTTCTTTAAGTAACCGGC','CAAGTTTTTCTTTAAGTAACCGGCT','AAGTTTTTCTTTAAGTAACCGGCTT','AGTTTTTCTTTAAGTAACCGGCTTT','GTTTTTCTTTAAGTAACCGGCTTTC','TTTTTCTTTAAGTAACCGGCTTTCA','TTTTCTTTAAGTAACCGGCTTTCAG','TTTCTTTAAGTAACCGGCTTTCAGC','TTCTTTAAGTAACCGGCTTTCAGCC','TCTTTAAGTAACCGGCTTTCAGCCT','C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CCCCATTA','GCGCGAAATACTCCTTCCCCATTAA','CGCGAAATACTCCTTCCCCATTAAC','GCGAAATACTCCTTCCCCATTAACA','CGAAATACTCCTTCCCCATTAACAC','GAAATACTCCTTCCCCATTAACACC','AAATACTCCTTCCCCATTAACACCG','AATACTCCTTCCCCATTAACACCGC','ATACTCCTTCCCCATTAACACCGCC','TACTCCTTCCCCATTAACACCGCCA','ACTCCTTCCCCATTAACACCGCCAT','CTCCTTCCCCATTAACACCGCCATC','TCCTTCCCCATTAACACCGCCATCA','CCTTCCCCATTAACACCGCCATCAT','CTTCCCCATTAACACCGCCATCATG','TTCCCCATTAACACCGCCATCATGC','TCCCCATTAACACCGCCATCATGCG','CCCCATTAACACCGCCATCATGCGA','CCCATTAACACCGCCATCATGCGAT','CCATTAACACCGCCATCATGCGATT','CATTAACACCGCCATCATGCGATTT','ATTAACACCGCCATCATGCGATTTC','TTAACACCGCCATCATGCGATTTCG','TAACACCGCCATCATGCGATTTCGG','AACACCGCCATCATGCGATTTCGGG','ACACCGCCATCATGCGATTTCGGGG','CACCGCCATCATGCGATTTCGGGGT','ACCGCCATCATGCGATTTCGGGGTA','CCGCCATCATGCGATTTCGGGGTAG','CGCCATCATGCGATTTCGGGGTAGA','GCCATCATGCGATTTCGGGGTAGAA','CCATCATGCGATTTCGGGGTAGAAG','CATCATGCGATTTCGGGGTAGAAGT','ATCATGCGATTTCGGGGTAGAAGTG','TCATGCGATTTCGGGGTAGAAGTGC','CATGCGATTTCGGGGTAGAAGTGCG','ATGCGATTTCGGGGTAGAAGTGCGA','TGCGATTTCGGGGTAGAAGTGCGAA','GCGATTTCGGGGTAGAAGTGCGAAG','CGATTTCGGGGTAGAAGTGCGAAGT','GATTTCGGGGTAGAAGTGCGAAGTA','ATTTCGGGGTAGAAGTGCGAAGTAC','TTTCGGGGTAGAAGTGCGAAGTACC','TTCGGGGTAGAAGTGCGAAGTACCT','TCGGGGTAGAAGTGCGAAGTACCTG','CGGGGTAGAAGTGCGAAGTACCTGG','GGGGTAGAAGTGCGAAGTACCTGGC','GGGTAGAAGTGCGAAGTACCTGGCG','GGTAGAAGTGCGAAGTACCTGGCGT','GTAGAAGTGCGAAGTACCTGGCGTA','TAGAAGTGCGAAGTACCTGGCGTAT','AGAAGTGCGAAGTACCTGGCGTATT','GAAGTGCGAAGTACCTGGCGTATTG','AAGTGCGAAGTACCTGGCGTATTGG','AGTGCGAAGTACCTGGCGTATTGGC','GTGCGAAGTACCTGGCGTATTGGCC','TGCGAAGTACCTGGCGTATTGGCCA','GCGAAGTACCTGGCGTATTGGCCAC','CGAAGTACCTGGCGTATTGGCCACC','GAAGTACCTGGCGTATTGGCCACCT','AAGTACCTGGCGTATTGGCCACCTC','AGTACCTGGCGTATTGGCCACCTCG','GTACCTGGCGTATTGGCCACCTCGA','TACCTGGCGTATTGGCCACCTCGAG','ACCTGGCGTATTGGCCACCTCGAGT','CCTGGCGTATTGGCCACCTCGAGTA','CTGGCGTATTGGCCACCTCGAGTAC','TGGCGTATTGGCCACCTCGAGTACT','GGCGTATTGGCCACCTCGAGTACTA','GCGTATTGGCCACCTCGAGTACTAA','CGTATTGGCCACCTCGAGTACTAAG','GTATTGGCCACCTCGAGTACTAAGT','TATTGGCCACCTCGAGTACTAAGTC','ATTGGCCACCTCGAGTACTAAGTCA','TTGGCCACCTCGAGTACTAAGTCAG','TGGCCACCTCGAGTACTAAGTCAGA','GGCCACCTCGAGTACTAAGTCAGAA','GCCACCTCGAGTACTAAGTCAGAAA','CCACCTCGAGTACTAAGTCAGAAAG','CACCTCGAGTACTAAGTCAGAAAGG','ACCTCGAGTACTAAGTCAGAAAGGT','CCTCGAGTACTAAGTCAGAAAGGTA','CTCGAGTACTAAGTCAGAAAGGTAG','TCGAGTACTAAGTCAGAAAGGTAGG','CGAGTACTAAGTCAGAAAGGTAGGC','GAGTACTAAGTCAGAAAGGTAGGCT','AGTACTAAGTCAGAAAGGTAGGCTA','GTACTAAGTCAGAAAGGTAGGCTAA','TACTAAGTCAGAAAGGTAGGCTAAC','ACTAAGTCAGAAAGGTAGGCTAACA','CTAAGTCAGAAAGGTAGGCTAACAG','TAAGTCAGAAAGGTAGGCTAACAGC','AAGTCAGAAAGGTAGGCTAACAGCG','AGTCAGAAAGGTAGGCTAACAGCGA','GTCAGAAAGGTAGGCTAACAGCGAG','TCAGAAAGGTAGGCTAACAGCGAGG','CAGAAAGGTAGGCTAACAGCGAGGA','AGAAAGGTAGGCTAACAGCGAGGAC','GAAAGGTAGGCTAACAGCGAGGACA','AAAGGTAGGCTAACAGCGAGGACAC','AAGGTAGGCTAACAGCGAGGACACA','AGGTAGGCTAACAGCGAGGACACAC','GGTAGGCTAACAGCGAGGACACACC','GTAGGCTAACAGCGAGGACACACCC','TAGGCTAACAGCGAGGACACACCCC','AGGCTAACAGCGAGGACACACCCCC','GGCTAACAGCGAGGACACACCCCCT','GCTAACAGCGAGGACACACCCCCTG','CTAACAGCGAGGACACACCCCCTGG','TAACAGCGAGGACACACCCCCTGGA','AACAGCGAGGACACACCCCCTGGAA','ACAGCGAGGACACACCCCCTGGAAT','CAGCGAGGACACACCCCCTGGAATA','AGCGAGGACACACCCCCTGGAATAC','GCGAGGACACACCCCCTGGAATACG','CGAGGACACACCCCCTGGAATACGA','GAGGACACACCCCCTGGAATACGAA','AGGACACACCCCCTGGAATACGAAG','GGACACACCCCCTGGAATACGAAGG','GACACACCCCCTGGAATACGAAGGG','ACACACCCCCTGGAATACGAAGGGA','CACACCCCCTGGAATACGAAGGGAC','ACACCCCCTGGAATACGAAGGGACC','CACCCCCTGGAATACGAAGGGACCC','ACCCCCTGGAATACGAAGGGACCCC','CCCCCTGGAATACGAAGGGACCCCC','CCCCTGGAATACGAAGGGACCCCCC','CCCTGGAATACGAAGGGACCCCCCA','CCTGGAATACGAAGGGACCCCCCAT','CTGGAATACGAAGGGACCCCCCATC','TGGAATACGAAGGGACCCCCCATCG','GGAATACGAAGGGACCCCCCATCGG','GAATACGAAGGGACCCCCCATCGGT','AATACGAAGGGACCCCCCATCGGTA','ATACGAAGGGACCCCCCATCGGTAA','TACGAAGGGACCCCCCATCGGTAAG','ACGAAGGGACCCCCCATCGGTAAGG','CGAAGGGACCCCCCATCGGTAAGGG','GAAGGGACCCCCCATCGGTAAGGGC','AAGGGACCCCCCATCGGTAAGGGCA','AGGGACCCCCCATCGGTAAGGGCAA','GGGACCCCCCATCGGTAAGGGCAAG','GGACCCCCCATCGGTAAGGGCAAGG','GACCCCCCATCGGTAAGGGCAAGGC','ACCCCCCATCGGTAAGGGCAAGGCC','CCCCCCATCGGTAAGGGCAAGGCCA','CCCCCATCGGTAAGGGCAAGGCCAA','CCCCATCGGTAAGGGCAAGGCCAAG','CCCATCGGTAAGGGCAAGGCCAAGT','CCATCGGTAAGGGCAAGGCCAAGTC','CATCGGTAAGGGCAAGGCCAAGTCC','ATCGGTAAGGGCAAGGCCAAGTCCA','TCGGTAAGGGCAAGGCCAAGTCCAC','CGGTAAGGGCAAGGCCAAGTCCACG','GGTAAGGGCAAGGCCAAGTCCACGT','GTAAGGGCAAGGCCAAGTCCACGTA','TAAGGGCAAGGCCAAGTCCACGTAA','AAGGGCAAGGCCAAGTCCACGTAAA','AGGGCAAGGCCAAGTCCACGTAAAA','GGGCAAGGCCAAGTCCACGTAAAAT','GGCAAGGCCAAGTCCACGTAAAATG','GCAAGGCCAAGTCCACGTAAAATGG','CAAGGCCAAGTCCACGTAAAATGGT','AAGGCCAAGTCCACGTAAAATGGTA','AGGCCAAGTCCACGTAAAATGGTAG','GGCCAAGTCCACGTAAAATGGTAGG','GCCAAGTCCACGTAAAATGGTAGGA','CCAAGTCCACGTAAAATGGTAGGAT','CAAGTCCACGTAAAATGGTAGGATG','AAGTCCACGTAAAATGGTAGGATGC','AGTCCACGTAAAATGGTAGGATGCG','GTCCACGTAAAATGGTAGGATGCGT','TCCACGTAAAATGGTAGGATGCGTT','CCACGTAAAATGGTAGGATGCGTTT','CACGTAAAATGGTAGGATGCGTTTC','ACGTAAAATGGTAGGATGCGTTTCT','CGTAAAATGGTAGGATGCGTTTCTA','GTAAAATGGTAGGATGCGTTTCTAA','TAAAATGGTAGGATGCGTTTCTAAG','AAAATGGTAGGATGCGTTTCTAAGA','AAATGGTAGGATGCGTTTCTAAGAC','AATGGTAGGATGCGTTTCTAAGACC','ATGGTAGGATGCGTTTCTAAGACCA','TGGTAGGATGCGTTTCTAAGACCAA','GGTAGGATGCGTTTCTAAGACCAAC','GTAGGATGCGTTTCTAAGACCAACG','TAGGATGCGTTTCTAAGACCAACGA','AGGATGCGTTTCTAAGACCAACGAC','GGATGCGTTTCTAAGACCAACGACT','GATGCGTTTCTAAGACCAACGACTA','ATGCGTTTCTAAGACCAACGACTAT','TGCGTTTCTAAGACCAACGACTATG','GCGTTTCTAAGACCAACGACTATGG','CGTTTCTAAGACCAACGACTATGGT','GTTTCTAAGACCAACGACTATGGTA','TTTCTAAGACCAACGACTATGGTAG','TTCTAAGACCAACGACTATGGTAGA','TCTAAGACCAACGACTATGGTAGAT','CTAAGACCAACGACTATGGTAGATT','TAAGACCAACGACTATGGTAGATTT','AAGACCAACGACTATGGTAGATTTT','AGACCAACGACTATGGTAGATTTTT','GACCAACGACTATGGTAGATTTTTG','ACCAACGACTATGGTAGATTTTTGG','CCAACGACTATGGTAGATTTTTGGG','CAACGACTATGGTAGATTTTTGGGA','AACGACTATGGTAGATTTTTGGGAG','ACGACTATGGTAGATTTTTGGGAGA','CGACTATGGTAGATTTTTGGGAGAA','GACTATGGTAGATTTTTGGGAGAAC','ACTATGGTAGATTTTTGGGAGAACG','CTATGGTAGATTTTTGGGAGAACGA','TATGGTAGATTTTTGGGAGAACGAG','ATGGTAGATTTTTGGGAGAACGAGC','TGGTAGATTTTTGGGAGAACGAGCT','GGTAGATTTTTGGGAGAACGAGCTT','GTAGATTTTTGGGAGAACGAGCTTT','TAGATTTTTGGGAGAACGAGCTTTG','AGATTTTTGGGAGAACGAGCTTTGG','GATTTTTGGGAGAACGAGCTTTGGT','ATTTTTGGGAGAACGAGCTTTGGTC','TTTTTGGGAGAACGAGCTTTGGTCG','TTTTGGGAGAACGAGCTTTGGTCGT','TTTGGGAGAACGAGCTTTGGTCGTC','TTGGGAGAACGAGCTTTGGTCGTCG','TGGGAGAACGAGCTTTGGTCGTCGG','GGGAGAACGAGCTTTGGTCGTCGGT','GGAGAACGAGCTTTGGTCGTCGGTC','GAGAACGAGCTTTGGTCGTCGGTCG','AGAACGAGCTTTGGTCGTCGGTCGT','GAACGAGCTTTGGTCGTCGGTCGTA','AACGAGCTTTGGTCGTCGGTCGTAA','ACGAGCTTTGGTCGTCGGTCGTAAG','CGAGCTTTGGTCGTCGGTCGTAAGT','GAGCTTTGGTCGTCGGTCGTAAGTA','AGCTTTGGTCGTCGGTCGTAAGTAG','GCTTTGGTCGTCGGTCGTAAGTAGG','CTTTGGTCGTCGGTCGTAAGTAGGC','TTTGGTCGTCGGTCGTAAGTAGGCC','TTGGTCGTCGGTCGTAAGTAGGCCC','TGGTCGTCGGTCGTAAGTAGGCCCA','GGTCGTCGGTCGTAAGTAGGCCCAG','GTCGTCGGTCGTAAGTAGGCCCAGA','TCGTCGGTCGTAAGTAGGCCCAGAT','CGTCGGTCGTAAGTAGGCCCAGATA','GTCGGTCGTAAGTAGGCCCAGATAA','TCGGTCGTAAGTAGGCCCAGATAAC','CGGTCGTAAGTAGGCCCAGATAACG','GGTCGTAAGTAGGCCCAGATAACGG','GTCGTAAGTAGGCCCAGATAACGGA','TCGTAAGTAGGCCCAGATAACGGAC','CGTAAGTAGGCCCAGATAACGGACG','GTAAGTAGGCCCAGATAACGGACGG','TAAGTAGGCCCAGATAACGGACGGA','AAGTAGGCCCAGATAACGGACGGAG','AGTAGGCCCAGATAACGGACGGAGC','GTAGGCCCAGATAACGGACGGAGCT','TAGGCCCAGATAACGGACGGAGCTA','AGGCCCAGATAACGGACGGAGCTAG','GGCCCAGATAACGGACGGAGCTAGC','GCCCAGATAACGGACGGAGCTAGCT','CCCAGATAACGGACGGAGCTAGCTA','CCAGATAACGGACGGAGCTAGCTAC','CAGATAACGGACGGAGCTAGCTACA','AGATAACGGACGGAGCTAGCTACAG','GATAACGGACGGAGCTAGCTACAGG','ATAACGGACGGAGCTAGCTACAGGA','TAACGGACGGAGCTAGCTACAGGAT','AACGGACGGAGCTAGCTACAGGATG','ACGGACGGAGCTAGCTACAGGATGA','CGGACGGAGCTAGCTACAGGATGAG','GGACGGAGCTAGCTACAGGATGAGC','GACGGAGCTAGCTACAGGATGAGCC','ACGGAGCTAGCTACAGGATGAGCCT','CGGAGCTAGCTACAGGATGAGCCTC','GGAGCTAGCTACAGGATGAGCCTCG','GAGCTAGCTACAGGATGAGCCTCGA','AGCTAGCTACAGGATGAGCCTCGAG','GCTAGCTACAGGATGAGCCTCGAGA','CTAGCTACAGGATGAGCCTCGAGAA','TAGCTACAGGATGAGCCTCGAGAAT','AGCTACAGGATGAGCCTCGAGAATA','GCTACAGGATGAGCCTCGAGAATAC','CTACAGGATGAGCCTCGAGAATACA','TACAGGATGAGCCTCGAGAATACAC','ACAGGATGAGCCTCGAGAATACACG','CAGGATGAGCCTCGAGAATACACGG','AGGATGAGCCTCGAGAATACACGGC','GGATGAGCCTCGAGAATACACGGCC','GATGAGCCTCGAGAATACACGGCCG','ATGAGCCTCGAGAATACACGGCCGG','TGAGCCTCGAGAATACACGGCCGGG','GAGCCTCGAGAATACACGGCCGGGC','AGCCTCGAGAATACACGGCCGGGCA','GCCTCGAGAATACACGGCCGGGCAC','CCTCGAGAATACACGGCCGGGCACG','CTCGAGAATACACGGCCGGGCACGG','TCGAGAATACACGGCCGGGCACGGA','CGAGAATACACGGCCGGGCACGGAC','GAGAATACACGGCCGGGCACGGACT','AGAATACACGGCCGGGCACGGACTC','GAATACACGGCCGGGCACGGACTCC','AATACACGGCCGGGCACGGACTCCG','ATACACGGCCGGGCACGGACTCCGC','TACACGGCCGGGCACGGACTCCGCG','ACACGGCCGGGCACGGACTCCGCGA','CACGGCCGGGCACGGACTCCGCGAA','ACGGCCGGGCACGGACTCCGCGAAC','CGGCCGGGCACGGACTCCGCGAACC','GGCCGGGCACGGACTCCGCGAACCA','GCCGGGCACGGACTCCGCGAACCAA','CCGGGCACGGACTCCGCGAACCAAG','CGGGCACGGACTCCGCGAACCAAGT','GGGCACGGACTCCGCGAACCAAGTC','GGCACGGACTCCGCGAACCAAGTCT','GCACGGACTCCGCGAACCAAGTCTA','CACGGACTCCGCGAACCAAGTCTAA','ACGGACTCCGCGAACCAAGTCTAAC','CGGACTCCGCGAACCAAGTCTAACT','GGACTCCGCGAACCAAGTCTAACTT','GACTCCGCGAACCAAGTCTAACTTC','ACTCCGCGAACCAAGTCTAACTTCA','CTCCGCGAACCAAGTCTAACTTCAT','TCCGCGAACCAAGTCTAACTTCATC','CCGCGAACCAAGTCTAACTTCATCT','CGCGAACCAAGTCTAACTTCATCTG','GCGAACCAAGTCTAACTTCATCTGG','CGAACCAAGTCTAACTTCATCTGGT','GAACCAAGTCTAACTTCATCTGGTT','AACCAAGTCTAACTTCATCTGGTTT','ACCAAGTCTAACTTCATCTGGTTTG','CCAAGTCTAACTTCATCTGGTTTGA','CAAGTCTAACTTCATCTGGTTTGAC','AAGTCTAACTTCATCTGGTTTGACC','AGTCTAACTTCATCTGGTTTGACCC','GTCTAACTTCATCTGGTTTGACCCC','TCTAACTTCATCTGGTTTGACCCCT','CTAACTTCATCTGGTTTGACCCCTA','TAACTTCATCTGGTTTGACCCCTAT','AACTTCATCTGGTTTGACCCCTATG','ACTTCATCTGGTTTGACCCCTATGG','CTTCATCTGGTTTGACCCCTATGGA','TTCATCTGGTTTGACCCCTATGGAG','TCATCTGGTTTGACCCCTATGGAGT','CATCTGGTTTGACCCCTATGGAGTC','ATCTGGTTTGACCCCTATGGAGTCA','TCTGGTTTGACCCCTATGGAGTCAA','CTGGTTTGACCCCTATGGAGTCAAC','TGGTTTGACCCCTATGGAGTCAACA','GGTTTGACCCCTATGGAGTCAACAA','GTTTGACCCCTATGGAGTCAACAAA','TTTGACCCCTATGGAGTCAACAAAG','TTGACCCCTATGGAGTCAACAAAGA','TGACCCCTATGGAGTCAACAAAGAC','GACCCCTATGGAGTCAACAAAGACA','ACCCCTATGGAGTCAACAAAGACAT','CCCCTATGGAGTCAACAAAGACATA','CCCTATGGAGTCAACAAAGACATAA','CCTATGGAGTCAACAAAGACATAAT','CTATGGAGTCAACAAAGACATAATA','TATGGAGTCAACAAAGACATAATAC','ATGGAGTCAACAAAGACATAATACG','TGGAGTCAACAAAGACATAATACGC','GGAGTCAACAAAGACATAATACGCC','GAGTCAACAAAGACATAATACGCCG','AGTCAACAAAGACATAATACGCCGT','GTCAACAAAGACATAATACGCCGTC','TCAACAAAGACATAATACGCCGTCG','CAACAAAGACATAATACGCCGTCGG','AACAAAGACATAATACGCCGTCGGA','ACAAAGACATAATACGCCGTCGGAG','CAAAGACATAATACGCCGTCGGAGA','AAAGACATAATACGCCGTCGGAGAC','AAGACATAATACGCCGTCGGAGACG','AGACATAATACGCCGTCGGAGACGT','GACATAATACGCCGTCGGAGACGTT','ACATAATACGCCGTCGGAGACGTTG','CATAATACGCCGTCGGAGACGTTGC','ATAATACGCCGTCGGAGACGTTGCC','TAATACGCCGTCGGAGACGTTGCCT','AATACGCCGTCGGAGACGTTGCCTT','ATACGCCGTCGGAGACGTTGCCTTG','TACGCCGTCGGAGACGTTGCCTTGT','ACGCCGTCGGAGACGTTGCCTTGTT','CGCCGTCGGAGACGTTGCCTTGTTG','GCCGTCGGAGACGTTGCCTTGTTGA','CCGTCGGAGACGTTGCCTTGTTGAA','CGTCGGAGACGTTGCCTTGTTGAAG','GTCGGAGACGTTGCCTTGTTGAAGC','TCGGAGACGTTGCCTTGTTGAAGCC','CGGAGACGTTGCCTTGTTGAAGCCC','GGAGACGTTGCCTTGTTGAAGCCCC','GAGACGTTGCCTTGTTGAAGCCCCA','AGACGTTGCCTTGTTGAAGCCCCAG','GACGTTGCCTTGTTGAAGCCCCAGA','ACGTTGCCTTGTTGAAGCCCCAGAC','CGTTGCCTTGTTGAAGCCCCAGACT','GTTGCCTTGTTGAAGCCCCAGACTG','TTGCCTTGTTGAAGCCCCAGACTGA','TGCCTTGTTGAAGCCCCAGACTGAT','GCCTTGTTGAAGCCCCAGACTGATA','CCTTGTTGAAGCCCCAGACTGATAT','CTTGTTGAAGCCCCAGACTGATATC','TTGTTGAAGCCCCAGACTGATATCA','TGTTGAAGCCCCAGACTGATATCAA','GTTGAAGCCCCAGACTGATATCAAC','TTGAAGCCCCAGACTGATATCAACC','TGAAGCCCCAGACTGATATCAACCC','GAAGCCCCAGACTGATATCAACCCT','AAGCCCCAGACTGATATCAACCCTT','AGCCCCAGACTGATATCAACCCTTC','GCCCCAGACTGATATCAACCCTTCT','CCCCAGACTGATATCAACCCTTCTA','CCCAGACTGATATCAACCCTTCTAT','CCAGACTGATATCAACCCTTCTATA','CAGACTGATATCAACCCTTCTATAG','AGACTGATATCAACCCTTCTATAGG','GACTGATATCAACCCTTCTATAGGA','ACTGATATCAACCCTTCTATAGGAG','CTGATATCAACCCTTCTATAGGAGT','TGATATCAACCCTTCTATAGGAGTA','GATATCAACCCTTCTATAGGAGTAG','ATATCAACCCTTCTATAGGAGTAGT','TATCAACCCTTCTATAGGAGTAGTG','ATCAACCCTTCTATAGGAGTAGTGT','TCAACCCTTCTATAGGAGTAGTGTC','CAACCCTTCTATAGGAGTAGTGTCC','AACCCTTCTATAGGAGTAGTGTCCC','ACCCTTCTATAGGAGTAGTGTCCCT','CCCTTCTATAGGAGTAGTGTCCCTA','CCTTCTATAGGAGTAGTGTCCCTAG','CTTCTATAGGAGTAGTGTCCCTAGG','TTCTATAGGAGTAGTGTCCCTAGGT','TCTATAGGAGTAGTGTCCCTAGGTC','CTATAGGAGTAGTGTCCCTAGGTCC','TATAGGAGTAGTGTCCCTAGGTCCA','ATAGGAGTAGTGTCCCTAGGTCCAC','TAGGAGTAGTGTCCCTAGGTCCACG','AGGAGTAGTGTCCCTAGGTCCACGA','GGAGTAGTGTCCCTAGGTCCACGAG','GAGTAGTGTCCCTAGGTCCACGAGC','AGTAGTGTCCCTAGGTCCACGAGCC','GTAGTGTCCCTAGGTCCACGAGCCA','TAGTGTCCCTAGGTCCACGAGCCAT','AGTGTCCCTAGGTCCACGAGCCATC','GTGTCCCTAGGTCCACGAGCCATCC','TGTCCCTAGGTCCACGAGCCATCCT','GTCCCTAGGTCCACGAGCCATCCTC','TCCCTAGGTCCACGAGCCATCCTCC','CCCTAGGTCCACGAGCCATCCTCCT','CCTAGGTCCACGAGCCATCCTCCTG','CTAGGTCCACGAGCCATCCTCCTGT','TAGGTCCACGAGCCATCCTCCTGTT','AGGTCCACGAGCCATCCTCCTGTTT','GGTCCACGAGCCATCCTCCTGTTTG','GTCCACGAGCCATCCTCCTGTTTGG','TCCACGAGCCATCCTCCTGTTTGGT','CCACGAGCCATCCTCCTGTTTGGTT','CACGAGCCATCCTCCTGTTTGGTTC','ACGAGCCATCCTCCTGTTTGGTTCG','CGAGCCATCCTCCTGTTTGGTTCGC','GAGCCATCCTCCTGTTTGGTTCGCG','AGCCATCCTCCTGTTTGGTTCGCGA','GCCATCCTCCTGTTTGGTTCGCGAA','CCATCCTCCTGTTTGGTTCGCGAAT','CATCCTCCTGTTTGGTTCGCGAATC','ATCCTCCTGTTTGGTTCGCGAATCA','TCCTCCTGTTTGGTTCGCGAATCAA','CCTCCTGTTTGGTTCGCGAATCAAA','CTCCTGTTTGGTTCGCGAATCAAAT','TCCTGTTTGGTTCGCGAATCAAATA','CCTGTTTGGTTCGCGAATCAAATAG','CTGTTTGGTTCGCGAATCAAATAGG','TGTTTGGTTCGCGAATCAAATAGGT','GTTTGGTTCGCGAATCAAATAGGTA','TTTGGTTCGCGAATCAAATAGGTAC','TTGGTTCGCGAATCAAATAGGTACC','TGGTTCGCGAATCAAATAGGTACCA','GGTTCGCGAATCAAATAGGTACCAT','GTTCGCGAATCAAATAGGTACCATG','TTCGCGAATCAAATAGGTACCATGA','TCGCGAATCAAATAGGTACCATGAT','CGCGAATCAAATAGGTACCATGATT','GCGAATCAAATAGGTACCATGATTA','CGAATCAAATAGGTACCATGATTAG','GAATCAAATAGGTACCATGATTAGA','AATCAAATAGGTACCATGATTAGAA','ATCAAATAGGTACCATGATTAGAAG','TCAAATAGGTACCATGATTAGAAGC','CAAATAGGTACCATGATTAGAAGCG','AAATAGGTACCATGATTAGAAGCGA','AATAGGTACCATGATTAGAAGCGAT','ATAGGTACCATGATTAGAAGCGATC','TAGGTACCATGATTAGAAGCGATCT','AGGTACCATGATTAGAAGCGATCTT','GGTACCATGATTAGAAGCGATCTTA','GTACCATGATTAGAAGCGATCTTAA','TACCATGATTAGAAGCGATCTTAAA','ACCATGATTAGAAGCGATCTTAAAT','CCATGATTAGAAGCGATCTTAAATC','CATGATTAGAAGCGATCTTAAATCT','ATGATTAGAAGCGATCTTAAATCTC','TGATTAGAAGCGATCTTAAATCTCA','GATTAGAAGCGATCTTAAATCTCAT','ATTAGAAGCGATCTTAAATCTCATG','TTAGAAGCGATCTTAAATCTCATGC','TAGAAGCGATCTTAAATCTCATGCT','AGAAGCGATCTTAAATCTCATGCTC','GAAGCGATCTTAAATCTCATGCTCA','AAGCGATCTTAAATCTCATGCTCAT','AGCGATCTTAAATCTCATGCTCATG','GCGATCTTAAATCTCATGCTCATGC','CGATCTTAAATCTCATGCTCATGCT','GATCTTAAATCTCATGCTCATGCTG','ATCTTAAATCTCATGCTCATGCTGG','TCTTAAATCTCATGCTCATGCTGGC','CTTAAATCTCATGCTCATGCTGGCT','TTAAATCTCATGCTCATGCTGGCTT','TAAATCTCATGCTCATGCTGGCTTG','AAATCTCATGCTCATGCTGGCTTGC','AATCTCATGCTCATGCTGGCTTGCA','ATCTCATGCTCATGCTGGCTTGCAT','TCTCATGCTCATGCTGGCTTGCATT','CTCATGCTCATGCTGGCTTGCATTA','TCATGCTCATGCTGGCTTGCATTAG','CATGCTCATGCTGGCTTGCATTAGG','ATGCTCATGCTGGCTTGCATTAGGT','TGCTCATGCTGGCTTGCATTAGGTA','GCTCATGCTGGCTTGCATTAGGTAA','CTCATGCTGGCTTGCATTAGGTAAG','TCATGCTGGCTTGCATTAGGTAAGC','CATGCTGGCTTGCATTAGGTAAGCG','ATGCTGGCTTGCATTAGGTAAGCGC','TGCTGGCTTGCATTAGGTAAGCGCG','GCTGGCTTGCATTAGGTAAGCGCGT','CTGGCTTGCATTAGGTAAGCGCGTT','TGGCTTGCATTAGGTAAGCGCGTTT','GGCTTGCATTAGGTAAGCGCGTTTA','GCTTGCATTAGGTAAGCGCGTTTAT','CTTGCATTAGGTAAGCGCGTTTATG','TTGCATTAGGTAAGCGCGTTTATGC','TGCATTAGGTAAGCGCGTTTATGCT','GCATTAGGTAAGCGCGTTTATGCTT','CATTAGGTAAGCGCGTTTATGCTTG','ATTAGGTAAGCGCGTTTATGCTTGC','TTAGGTAAGCGCGTTTATGCTTGCG','TAGGTAAGCGCGTTTATGCTTGCGA','AGGTAAGCGCGTTTATGCTTGCGAA','GGTAAGCGCGTTTATGCTTGCGAAT','GTAAGCGCGTTTATGCTTGCGAATG','TAAGCGCGTTTATGCTTGCGAATGT','AAGCGCGTTTATGCTTGCGAATGTC','AGCGCGTTTATGCTTGCGAATGTCG','GCGCGTTTATGCTTGCGAATGTCGT','CGCGTTTATGCTTGCGAATGTCGTT','GCGTTTATGCTTGCGAATGTCGTTG','CGTTTATGCTTGCGAATGTCGTTGA','GTTTATGCTTGCGAATGTCGTTGAG','TTTATGCTTGCGAATGTCGTTGAGT','TTATGCTTGCGAATGTCGTTGAGTA','TATGCTTGCGAATGTCGTTGAGTAT','ATGCTTGCGAATGTCGTTGAGTATA','TGCTTGCGAATGTCGTTGAGTATAT','GCTTGCGAATGTCGTTGAGTATATG','CTTGCGAATGTCGTTGAGTATATGC','TTGCGAATGTCGTTGAGTATATGCC','TGCGAATGTCGTTGAGTATATGCCC','GCGAATGTCGTTGAGTATATGCCCG','CGAATGTCGTTGAGTATATGCCCGT','GAATGTCGTTGAGTATATGCCCGTG','AATGTCGTTGAGTATATGCCCGTGG','ATGTCGTTGAGTATATGCCCGTGGG','TGTCGTTGAGTATATGCCCGTGGGT','GTCGTTGAGTATATGCCCGTGGGTG','TCGTTGAGTATATGCCCGTGGGTGA','CGTTGAGTATATGCCCGTGGGTGAC','GTTGAGTATATGCCCGTGGGTGACA','TTGAGTATATGCCCGTGGGTGACAC','TGAGTATATGCCCGTGGGTGACACT','GAGTATATGCCCGTGGGTGACACTT','AGTATATGCCCGTGGGTGACACTTT','GTATATGCCCGTGGGTGACACTTTA','TATATGCCCGTGGGTGACACTTTAC','ATATGCCCGTGGGTGACACTTTACC','TATGCCCGTGGGTGACACTTTACCC','ATGCCCGTGGGTGACACTTTACCCG','TGCCCGTGGGTGACACTTTACCCGT','GCCCGTGGGTGACACTTTACCCGTT','CCCGTGGGTGACACTTTACCCGTTA','CCGTGGGTGACACTTTACCCGTTAC','CGTGGGTGACACTTTACCCGTTACG','GTGGGTGACACTTTACCCGTTACGT','TGGGTGACACTTTACCCGTTACGTA','GGGTGACACTTTACCCGTTACGTAG','GGTGACACTTTACCCGTTACGTAGG','GTGACACTTTACCCGTTACGTAGGC','TGACACTTTACCCGTTACGTAGGCG','GACACTTTACCCGTTACGTAGGCGG','ACACTTTACCCGTTACGTAGGCGGT','CACTTTACCCGTTACGTAGGCGGTT','ACTTTACCCGTTACGTAGGCGGTTC','CTTTACCCGTTACGTAGGCGGTTCA','TTTACCCGTTACGTAGGCGGTTCAA','TTACCCGTTACGTAGGCGGTTCAAG','TACCCGTTACGTAGGCGGTTCAAGC','ACCCGTTACGTAGGCGGTTCAAGCG','CCCGTTACGTAGGCGGTTCAAGCGC','CCGTTACGTAGGCGGTTCAAGCGCA','CGTTACGTAGGCGGTTCAAGCGCAG','GTTACGTAGGCGGTTCAAGCGCAGT','TTACGTAGGCGGTTCAAGCGCAGTG','TACGTAGGCGGTTCAAGCGCAGTGC','ACGTAGGCGGTTCAAGCGCAGTGCC','CGTAGGCGGTTCAAGCGCAGTGCCC','GTAGGCGGTTCAAGCGCAGTGCCCG','TAGGCGGTTCAAGCGCAGTGCCCGT','AGGCGGTTCAAGCGCAGTGCCCGTT','GGCGGTTCAAGCGCAGTGCCCGTTG','GCGGTTCAAGCGCAGTGCCCGTTGG','CGGTTCAAGCGCAGTGCCCGTTGGG','GGTTCAAGCGCAGTGCCCGTTGGGA','GTTCAAGCGCAGTGCCCGTTGGGAA','TTCAAGCGCAGTGCCCGTTGGGAAA','TCAAGCGCAGTGCCCGTTGGGAAAG','CAAGCGCAGTGCCCGTTGGGAAAGT','AAGCGCAGTGCCCGTTGGGAAAGTA','AGCGCAGTGCCCGTTGGGAAAGTAG','GCGCAGTGCCCGTTGGGAAAGTAGA','CGCAGTGCCCGTTGGGAAAGTAGAT','GCAGTGCCCGTTGGGAAAGTAGATG','CAGTGCCCGTTGGGAAAGTAGATGG','AGTGCCCGTTGGGAAAGTAGATGGC','GTGCCCGTTGGGAAAGTAGATGGCA','TGCCCGTTGGGAAAGTAGATGGCAT','GCCCGTTGGGAAAGTAGATGGCATT','CCCGTTGGGAAAGTAGATGGCATTG','CCGTTGGGAAAGTAGATGGCATTGG','CGTTGGGAAAGTAGATGGCATTGGC','GTTGGGAAAGTAGATGGCATTGGCC','TTGGGAAAGTAGATGGCATTGGCCC','TGGGAAAGTAGATGGCATTGGCCCC','GGGAAAGTAGATGGCATTGGCCCCA','GGAAAGTAGATGGCATTGGCCCCAC','GAAAGTAGATGGCATTGGCCCCACT','AAAGTAGATGGCATTGGCCCCACTA','AAGTAGATGGCATTGGCCCCACTAC','AGTAGATGGCATTGGCCCCACTACA','GTAGATGGCATTGGCCCCACTACAT','TAGATGGCATTGGCCCCACTACATG','AGATGGCATTGGCCCCACTACATGT','GATGGCATTGGCCCCACTACATGTG','ATGGCATTGGCCCCACTACATGTGC','TGGCATTGGCCCCACTACATGTGCG','GGCATTGGCCCCACTACATGTGCGT','GCATTGGCCCCACTACATGTGCGTA','CATTGGCCCCACTACATGTGCGTAA','ATTGGCCCCACTACATGTGCGTAAG','TTGGCCCCACTACATGTGCGTAAGT','TGGCCCCACTACATGTGCGTAAGTC','GGCCCCACTACATGTGCGTAAGTCT','GCCCCACTACATGTGCGTAAGTCTC','CCCCACTACATGTGCGTAAGTCTCT','CCCACTACATGTGCGTAAGTCTCTA','CCACTACATGTGCGTAAGTCTCTAA','CACTACATGTGCGTAAGTCTCTAAA','ACTACATGTGCGTAAGTCTCTAAAT','CTACATGTGCGTAAGTCTCTAAATC','TACATGTGCGTAAGTCTCTAAATCC','ACATGTGCGTAAGTCTCTAAATCCT','CATGTGCGTAAGTCTCTAAATCCTT','ATGTGCGTAAGTCTCTAAATCCTTG','TGTGCGTAAGTCTCTAAATCCTTGC','GTGCGTAAGTCTCTAAATCCTTGCT','TGCGTAAGTCTCTAAATCCTTGCTG','GCGTAAGTCTCTAAATCCTTGCTGG','CGTAAGTCTCTAAATCCTTGCTGGC','GTAAGTCTCTAAATCCTTGCTGGCC','TAAGTCTCTAAATCCTTGCTGGCCA','AAGTCTCTAAATCCTTGCTGGCCAA','AGTCTCTAAATCCTTGCTGGCCAAT','GTCTCTAAATCCTTGCTGGCCAATC','TCTCTAAATCCTTGCTGGCCAATCA','CTCTAAATCCTTGCTGGCCAATCAC','TCTAAATCCTTGCTGGCCAATCACC','CTAAATCCTTGCTGGCCAATCACCC','TAAATCCTTGCTGGCCAATCACCCC','AAATCCTTGCTGGCCAATCACCCCC','AATCCTTGCTGGCCAATCACCCCCA','ATCCTTGCTGGCCAATCACCCCCAA','TCCTTGCTGGCCAATCACCCCCAAT','CCTTGCTGGCCAATCACCCCCAATG'],)
write_temp(kmer_path_to_string(*input))
print_sep("Overlap Graph")
print("""Solve the Overlap Graph Problem (restated below).
Input: A collection Patterns of k-mers.
Output: The overlap graph Overlap(Patterns), in the form of an adjacency list. (You may return the nodes and their edges in any order.)
Note: You don't need to account for repeated elements in Patterns in this problem.""")
test_overlap_graph()
input=(['CATTTTAGAACTTGTAGAGCCTAAG','TTGGAGTCTGTGCTGCTTTAATGCT','TCATAAAGGCTAAAAATAAGATCAC','CTAATTGCAAAAGGGATATCATAGT','AGTCGCCTCAGCTAGACCCCCATCG','TTACGTCTGCCTAATCCTTGTAGAG','TGTGCTTTGTTTGTGCCGCTGGGGA','GGGTAATGGACCGGGCGGATTACAC','TACATGGGCGCGCCAACTTCACCCA','AGCTAGTCCACAAATGATCGTTTTC','CGATGAGTCCTCAGATCGCTCGACC','CCAAGATATAACATCCTTGGCGACT','ACACAGCGACGTAATGATATTGAGA','TAACTAGCTGTTTAATGCCGGAGGA','TTCGTCCCCGCGTAAGGATGCCCAC','CCGTGGGAACAGCCACGGACAGATC','TTACTATGATGGCCTGTGTATCCGG','TCGGACGTAACTTAACCTTGGGTCA','CCAATCGCTTAGATACCATAAAGTT','GGATATATCGGGCCAGCGCCAATTT','CGTGGGAACAGCCACGGACAGATCG','ATAAGTGCATATTGCTCACCAGGGC','TGGGCGCCGTAGAGCATGGCGGCTT','TACGATATTCGTAATGTCTCAAGGC','CGACACAGCGACGTAATGATATTGA','CCGGAAATCCCCGAGAACAACGGTC','ACGCCCTGCCATTCCAGTTTGTGAG','TACCATGGCCATACAGTGACTTCGA','TATACTCTCGAGTGACAGACCAAAC','GGCGGGGTGCTTATTGAGTGGGCGC','CGATTAGTTGCATCTTGAACTGACA','CGGGCGTTCTCATAAAGGCTAAAAA','GCCGCTTGGCATCGGAACCGTCCCG','GTCATCGGCTTCGTAACGCACCGGA','ATTGATTCTTGTAAGGAATTCGGTA','TATATATCGGGTACAGACAGGTCCA','ATCGACGGCCGGGGTACGGCTTCCT','CTCCGTCGCGTTAGAGGGGAACCCT','AGGAGGGTCTCGATGTGGCGGTACG','AGGGTTGTATAGCAATTGATCAGTG','TGAACGCTCCGTCGCGTTAGAGGGG','CGGTCGAAACACTAATGTCCGAATA','TTCGAGCAAAGTCGCCTCAGCTAGA','ACATCTATAACGCAGTCACTACAGA','TACACACATGCGCAACCCGACTACA','GGCGTTCTCATAAAGGCTAAAAATA','AGCCGGCCGTTGGGGCTGTACTCGC','TGCTTATTGAGTGGGCGCTACTGTC','GGTTTACGGCAGAGTTAGCACCTTT','AGTGAATTCTTTCATAAATTTGGAA','GCATAGAGTCACCGTTGCTATACAT','CGTTTCACTTTGGAAAAATACACAG','GCTGTCGGGGAGAGGGGTGCGAATA','GTTGGGAGGGATGCCGTTGACTTCT','CGGTCATCATAAGCATTACACACAT','GCGTCTTTTGATGCGCATGACACAG','ACGTACCATAATCGACGACTGGGTG','CGTGCTATAAGTGCATATTGCTCAC','ACGGCGTTAGCGGCAGGTTGGGCTA','TCGGCCTGCTTCGTTGACGGATAGA','CCGCATGAACGCTCCGTCGCGTTAG','TTTCATAAATTTGGAATACCCATAT','AGTCGACCGACGTTACTATGATGGC','AACTACGTCTAGCGTCTCCGGCTCG','CCTCTCTGGCAAGAAACTTCGTTCC','AAGAGTGCGCGGGATGGGGGTCCGG','AGAGGGGAACCCTAGTTTCGAAGTG','CCAGGATCGGACCAGGTCTACGGGT','GGGAGGGGCGGAAGATATCTGCCTT','TCTTTTTTAGAAAACAACCGTATAT','GTTAAGGCATGTAACGCTGGGTTCG','ACTAGCAATTGGACCAGCCCCGATG','TAGGAGAGTCGACCGACGTTACTAT','GTTCCCAACCGTTTTTTATCATAAC','GTTAGCACCTTTTGAGCTGTTGCGT','ACTCATCCCTAGCTGAGAATATCTC','TCGTCCGTGTCCGGTGACAAGGGTT','GGGCTGCAGCGCGTCGGCAATCTCG','TTATGCGGATATATCGGGCCAGCGC','AAGCATTACACACATGCGCAACCCG','TTTTATTACTTATTCGAATTCGATT','TACCTGACGCCCTGCCATTCCAGTT','ATACTTCGGAAGCATGATCCACACC','AACTCCCCCCGATGTCAAAAGTCCG','GATATCATAGTGAGAGGTCGCCGTC','GCCAGAACCGTGTGTCCTCTCTGGC','TACTCTCGAGTGACAGACCAAACCT','AATGGGCACGGCGTTTGGCCGGCCT','AGTATATCGTAGAACCGGTCGAAAC','CTTTAAGTACTATGCGGATTCGAGC','TGGGGACTGATCGTATTGATTCTTG','ATCGGCTTCGTAACGCACCGGAGCA','CTACGGGATGCGGCGAATTTCGGCT','CAACCGTATATGTCCTCCTGGGAAC','CCACGGACAGATCGAGTGATACCTA','TTTGGCCGGCCTGAATTCCGTCTAT','GCTATTAGATCTTATCGTTGAGCGG','ATGGTGCCACAGACACCCGGCCAAA','GCACTAACCAGACGCCGACACAGCG','CTATCAGAATTACTCGGATGGATAC','CTGCCATTCCAGTTTGTGAGCGATG','TGCATCTAGTAATCCGCGCATGCCT','CTCGACCGGTTCAGCAACGTATATC','GCAGCGGGCTATCCGACGTCCGGAC','TGGGAACAGCCACGGACAGATCGAG','GAGCGATGGTCGTATTCGCCGCCAT','CCACAAGCACGAAACCCTGAAAGCG','GTCGGGGAGAGGGGTGCGAATAATT','TCACCAGGGCACGGCGTTAGCGGCA','CACGGCGTTAGCGGCAGGTTGGGCT','ATGAGCATCTTACGGATACGCTCAG','ACTAATGTCCGAATAGGGAGGTTGT','ATCTCCACGGTCGATTTCAAATTTA','GCTAAAGGTAGCGCAGAAGGGCTAG','CCCTTTTATTACTTATTCGAATTCG','GGGCTAAGTGCCAGGATCGGACCAG','CCGCTACTCATCCCTAGCTGAGAAT','CATGGCCATACAGTGACTTCGAGCA','GAGACCAGTGCCCCATGGGGATTAC','TTACTCATACACATACGAGTAGTAT','AATTGCAAAAGGGATATCATAGTGA','AATCAGGGGTCCTCTGTTAGGCTAA','GAGCGTGTTAACTCCCCCCGATGTC','GGCGGATTACACAGATCAACCCGAC','GATCTAGCAGCGGGCTATCCGACGT','AGAGTCGACCGACGTTACTATGATG','TTCTGTAAGCGATATTCGTCCCCGC','CTGGGAACCGTTGGCTATGATCGAC','TATTGGGATGTTCTTTATGGATTCT','CGCTGGGGACTGATCGTATTGATTC','CTTTGTCAAAACGTTACCGTGCTAT','AGCGCGCCGTGTTCGGACGTAACTT','AACGGAACCACTTACATCGATGATA','GGCTTTCCGTCGTTTCGATGCCTCA','GGATCTGTTTGGAAGATCCAATTGA','ATTACACACATGCGCAACCCGACTA','AAGAAGTCGAGTCGGACCGCAGGTT','TAATCCGCGCATGCCTACCTGTGGG','GATAGATTTCGCAGCGTCCGGCCTT','AAAGGAGGGTCTCGATGTGGCGGTA','TCCACAAATGATCGTTTTCAACGGC','GGCTTCACGTACGCTATTAGATCTT','GCGTCGGCAATCTCGGTCACAGCCT','GCGCGTCTTTTGATGCGCATGACAC','AGGTTGTGAGCGCCCTGAGTACATG','CCGTCTATAGGATTTATTTATTGGG','ACTTCGGGTAATGGACCGGGCGGAT','TTTTTAGAAAACAACCGTATATGTC','CACATATGCATTATCGGCCTGCTTC','TTGAGTGGGCGCTACTGTCAAGATA','TTATTGAGTGGGCGCTACTGTCAAG','ATAACTAGCTGTTTAATGCCGGAGG','TTACCCTACATTAGACATGAGCATC','ATATCGTAGAACCGGTCGAAACACT','CGACCGCATAGAGTCACCGTTGCTA','GGCGGGGTCTTCGTATTGGTATGAG','CAGTTTGTGAGCGATGGTCGTATTC','TCCTTATGACTCTGACAAATAGGTC','ATACGCTCAGATTGGGTCATCTCCG','AATAGTTGTTAGGGAATCCAAGATA','GTTGACTTCTCCGGGAGGGGCGGAA','TTATTGGGATGTTCTTTATGGATTC','AGCCAGGGCCGAGTTGGCTTTGTCC','GACCGCATAGAGTCACCGTTGCTAT','TCCAAGATATAACATCCTTGGCGAC','CCGCTTGGCATCGGAACCGTCCCGT','CTTTCCCGTGGGGCCAAAGAGGGCG','GAGCAAGATAACAAAGGAGGGTCTC','GTTATTTCCTTGGTTCCTAGATCCC','GTGCTTATTGAGTGGGCGCTACTGT','ATGCGACTTTACGGTGCACGCACTA','GACGGCGTTTTTTCACCGGGCAGTT','CGTTCTATCAGAATTACTCGGATGG','ATCATAACTTACAGTTGCGAACAGC','AGTTACACCCGTGTATTAGTAAACA','ATATAATGCGCGCACAGCGGTTCAC','ATGAGTCCTCAGATCGCTCGACCGG','CCTGACGCCCTGCCATTCCAGTTTG','GTGGTTT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ACACGAGACTCCACTGCCAGAA','ATGTCCTCCTGGGAACCGTTGGCTA','AGTCGGACCGCAGGTTGTGAGCGCC','CATGAGCATCTTACGGATACGCTCA','TAAGTACTATGCGGATTCGAGCAAT','TAAAAATAAGATCACGTACCATAAT','CTACTAGAGAATCAATCAGCCCCCA','GTGCTAACTGTGGCGGGGTCTTCGT','ACCGGATCCTATTTTATCTACACTA','GCCGGCCGTTGGGGCTGTACTCGCG','AAATACACAGAAACGGTTCGACTCG','TGACTCTGACAAATAGGTCTTAAGG','TAGAGTTTTGGAGTCTGTGCTGCTT','TCCTTGTAGAGGCGGTAAAGAGTGC','TTGGAAAAATACACAGAAACGGTTC','GTCTTTTGATGCGCATGACACAGTA','ATTAGAGCTCAGTTATGCGGATATA','CCGATAGGATATTTATACAGAGAGT','TAGAACCGGTCGAAACACTAATGTC','TTTATATCCCGTGGGAACAGCCACG','TCAAGCGGCTTCCGCGTATGAACGC','ATGCTGTGGTGTCATCGGCTTCGTA','AGATCAACCCGACTCACTAGCCGGG','AAGCCGAGCAAGATAACAAAGGAGG','CACATGGGCGCCGTAGAGCATGGCG','GCACAGCGGTTCACCGCTACTCATC','AACGTGTGCCCTCGTCAACGACTCA','ACAGAGTGTGGGGGCTCTGCGGACG','TAAGATCACGTACCATAATCGACGA','TTCGAAGTGAATTCTTTCATAAATT','TTTCTGTTCGTTTGCACACACTGCC','CCCCGATGAGTCCTCAGATCGCTCG','CTTTATGGATTCTTTTTTAGAAAAC','ATGATCGACGGCCGGGGTACGGCTT','AGCAAGATAACAAAGGAGGGTCTCG','TTAGGGTTGTATAGCAATTGATCAG','TCAAGATACTGTGCTACCACTACGT','CTACGATATTCGTAATGTCTCAAGG','AGGATCGGACCAGGTCTACGGGTTC','GTGAGACTGCCCGTTCTATCAGAAT','GTGTCTCGTCCGTGTCCGGTGACAA','ACGCAGTCACTACAGAGCGACTACA','CTCTGACAAATAGGTCTTAAGGCCA','CGTACGGCAGGAGTGGTTTAGCTGC','AGATAACAAAGGAGGGTCTCGATGT','TTCTCCGGGAGGGGCGGAAGATATC','TTCGTTCCAACTCAAGCGGCTTCCG','CGCGCGGGAGAACTACGTCTAGCGT','GCTGCTTTAATGCTGTGGTGTCATC','CCTAAGCCGAGCAAGATAACAAAGG','ACCAGTTGCAATACCTGACGCCCTG','TCTGGCGCTTTAATGGGCACGGCGT','GTTGGCTTTGTCCTGGACGTTGGCA','CGTTGACGGATAGATTTCGCAGCGT','AAGATACCTCCAGGTGCAGAGCCAT','ACTATGAGGAGATAGATACTTGTTC','GCGGCTCGTAATCTATTAGCGAGAG','TGGCATCGGAACCGTCCCGTGAGTG','AAGCATGATCCACACCAATAGTTGT','GGCAAGAAACTTCGTTCCAACTCAA','TAGCGCAGAAGGGCTAGCGCGCCGT','GGTCGCGTACCACACGGCGGGCGTA','GGTGTCTCGTCCGTGTCCGGTGACA','CGTTGGCTATGATCGACGGCCGGGG','AAGCGCTATACTCTCGAGTGACAGA','TCACTTTGGAAAAATACACAGAAAC','ACGACATCTCCCACTATTGAAGATA','GGTATCCACCGACCGCATAGAGTCA','CAGCCTGAAGATAACTCAGGGCATG','TCCGTCTACTAGAGAATCAATCAGC','GCTATAAGTGCATATTGCTCACCAG','CTTCGTATTGGTATGAGTCAAAGGG','TGCCGTTGACTTCTCCGGGAGGGGC','AGCCGCTTGGCATCGGAACCGTCCC','CTTTGTCCTGGACGTTGGCACTTAC','GTGCTTTGTTTGTGCCGCTGGGGAC','TTCGTAACGCACCGGAGCAAGGGCA','CCAAGTCTTGTGCTTTGTTTGTGCC','GGGCATTAGGAGAGTCGACCGACGT','GCAGGGCTTCACGTACGCTATTAGA','CACATGCGCAACCCGACTACACGCT','CGGTACGGCCCGAACGGGATAGAAC','GGGATGTTCTTTATGGATTCTTTTT','AACGTTACCGTGCTATAAGTGCATA','CGATGTCAAAAGTCCGTGACTAGGC','GGACTGCTGAGGTATTGTATATATC','ATGATCGTTTTCAACGGCGACAAGT','GTGGTGTCATCGGCTTCGTAACGCA','CCATTGAGGGCTTGATTACTAAAGA','TTCCCACCCGTGAACCAACCTGCAA','GCCTGTGTATCCGGGCGTTCTCATA','GGGCGTTAATACGCTAAAGATCCCT','ATCCTAAAGGCATAGATTTGGTACG','ATCTATAACGCAGTCACTACAGAGC','TACGCTAAAGATCCCTTTTATTACT','GGGCCAGCGCCAATTTGTCTCACTA','AGTTTTGGAGTCTGTGCTGCTTTAA','GGGGCTGTACTCGCGAGAGCGTGTT','GCTTCGTTGACGGATAGATTTCGCA','AGCAGGGCTTCACGTACGCTATTAG','CACGGCGGGCGTACGGCAGGAGTGG','GGGCGCGCCAACTTCACCCAAGAGG','TTTCCCGTGGGGCCAAAGAGGGCGT','ATTCTCGTTGTTATATAATGCGCGC','AGGGATGCCGTTGACTTCTCCGGGA','ACGGGTGTCTCGTCCGTGTCCGGTG','GCCGGGGTTTGGTTAGACTCGCCCT','CTTGGTTCCTAGATCCCATCGTTGT','CCACAGACACCCGGCCAAAACTAGC','TCACTACAGAGCGACTACACGGTCA','ATTCGTAATGTCTCAAGGCTACGAT','TTAGATACCATAAAGTTCCACCAGT','TGAGCTGTTGCGTATAGAGTTACAC','GCTAAAGACAAATAATAGGTGACCA','GCGCGCCGTGTTCGGACGTAACTTA','CGCCGAGGAAGCGCTATACTCTCGA','TGGACGTTGGCACTTACCAGGTGAG','CGCTCCAAGTCTTGTGCTTTGTTTG','CGTATCCGACCAGTTAGCTTCCCAC','TGAACGCTGTCTATACTTCGGAAGC','CGGGACATGTGTACTCCCAGTTTTC','GGTCGTATTCGCCGCCATTCTCGTT','GCCCACAATATCGGATCCACCTTGA','TGCCAGGATCTGTTTGGAAGATCCA','GGCATAGATTTGGTACGTTATTTCC','CCAGGTGCAGAGCCATAACTAGCTG','AAATCCCCGAGAACAACGGTCAGAT','GAACAGGGATCCTAAAGGCATAGAT','GCGTTTGGCCGGCCTGAATTCCGTC','AAGGTACGTGTGTTGGGAGGGATGC','CTATACTCTCGAGTGACAGACCAAA','CCGAATAGGGAGGTTGTTGTTTAGC','AGCATGGCGGCTTCCACTCCCCCGA','GAAGATCCAATTGATATGCTTGTCC','AACAAAGGAGGGTCTCGATGTGGCG','GCCCTGAGTACATGGGCGCGCCAAC','TATTGAAGATACCTCCAGGTGCAGA','GTTAGGCTAATATTCTTTCCCGTGG','GCCAGGATCGGACCAGGTCTACGGG','ATAGGTGACCATTAATACCATGGCC','GTAAGTTGCCGGTGCTGTCAAGGAC','TGTACTTAAAGTTAGGTCCGGTGAG','TTTGGCCACAAGCACGAAACCCTGA','TGAGACTGCCCGTTCTATCAGAATT','GATAACTCAGGGCATGCTCGAGTAT','GCGGATTCGAGCAATAGGGCTCGAT','GTTTCACTTTGGAAAAATACACAGA','GTTTGTGCCGCTGGGGACTGATCGT','CTTTAATGGGCACGGCGTTTGGCCG','GGAATACCCATATGGGAGGGGCTGC','CTCACTAGCCGGGGATATACCCCTG','CCAGTGCCCCATGGGGATTACAGAG','CTGTGGTGTCATCGGCTTCGTAACG','GATCTACGGGATGCGGCGAATTTCG','AGCAACTACGGTTACCCTACATTAG'],)
soln = overlap_graph(*input)
write_temp(format_dict(soln))
print_sep("De Bruijn Graph from a String")
print("""In general, given a genome Text, PathGraphk(Text) is the path consisting of |Text| - k + 1 edges, where the i-th edge of this path is labeled by the i-th k-mer in Text and the i-th node of the path is labeled by the i-th (k - 1)-mer in Text. The de Bruijn graph DeBruijnk(Text) is formed by gluing identically labeled nodes in PathGraphk(Text).
De Bruijn Graph from a String Problem: Construct the de Bruijn graph of a string.
Input: An integer k and a string Text.
Output: DeBruijnk(Text).""")
test_de_bruijn_graph()
input = ('GAATGCACCCCAATCCTGACGAGAACTACAGCCATGCGATGAGCCGCTGGGGAGCCAAATTACTAGACATTTAGAGAAGTCCTGGCTGTGCGTTAGACCTTGAATAGTATGTGGGTCTCGAGTCGAAACCTGGCTTGTATACGGGGTAGGTTACTTCAACGATACTGACTGAAACATGAATGCCGAATACGAATAGCGAGAGCTCCGCATTAGACGGTAGCATTTGTTCGGGTAAACCAACGTGCCTTTTTGGATGAGATAAAGGACTTGGTACTATGGTCTCAGGTTCGAAGTAGAAGCGTAGCACGTATTCCTGATCAAATTTTTGTAAGCGCGATTTCCCGCGTGTGCCAGGAATCGAATGTACCGTTATGTGATGTAAAATCACGAGGAACTTTGGGAAATTATACTAGTACATGGCGCCTTAATGCTCGCGATTAGATGCAAATTTCTAGGCAAAAAGCCCTGTGAGAGCGTTCGACGCATCATCTGAAAGGACAGCACTAAGAAGAGTGTTTGGTGGTGCGTAACCAAGTAACCAACAGAACCACTAAACACCATATCCCAGAAGAGCATCCCCGTAGGTCTACAGGGCATCGTGAAGGTAGGTCATCGCGTGGGAAGGTAACGACTTCCCTGGCTCAAGAGGCTGGAATCAATTATTGTATTGTGCTGGCTCCGAGTCCGTGTGCGGCCGGTTGAGATGCTGATGGGAGCCATTCCTTGTCGTTCATTAGCAAGATATGGAAGCTAATCCACTATATTCCGTTTGTCTTTTACGTCATAACGGCCTAGGAACTCACACATCGCGAGTACTGTCCCTATACTTTATGCCTACCCAGCAAATATAAGATAATTAATAAGGCATCTCATGACGCGGATTTGTTCTATAGTCGCGACCAGCGAACTTTTACCAAAACTACTTCGCAACCGATACGGACTTGCTCTATCTTACTGTTTCATGAGACCGTGAAGAGTTCGATTACACAAGGTGGCTGATTTGGTTCCCGCCAATACATAAAGCGAAACCTCGAACGCAGGTACTTAAAACCCTCACCAGGGATAGACTGGCGTCGTACACACGAACGCGTTTAACCTTGAGCTGAGCTTGACTGCTTGTGCATCTGCACGGGTAGCGTCGAGGTCCCGCAATTTAACCGTTCATTCGGCGTAAAATCCTAAATCAAGACCCGGCACATATAGAAATGAATATCTATTTCATTTAATGGTTACGCCGAATCCAATCATCCGAGAGCGTCATCCGCCGCAGTGGATTGCTATAGTCTATATTCGTCCAGAAGCGACGGGATGTTTTAGATATAATTTACAGTAGATGACTATCGATCCAACCTGTCGTCCATAAGGCTGGCGGGCCACCTCGGTTGTAACTAAACACCAAAACCCTATCTGAGGTGGGCCACTTCCCAGTACATGATGGAGGCCTCGTCGAAGTTCGCTGGAACATATACGCAACTCCGGTCTGCGGTAGTAGACCATTTCTACGTGACAAGCTATTGATTTTTCCTTCGCCGCTCCGCATGCACGAGTACAGGAACTAGCCTTCTCGACTATGCAGAAACACCACGGTAATGCTCCATCAATACCAGCGGCGGATCACGAAGCTGCGCAAGTCGCCCTCCCCAAGGTGAGTAGGCCGGGGTCAGAAGGGCAACCGCCGCTGTCTGCCCCAGTCACACTCTATTCGGGACGTCCATCACGCAGCGTCTTCGATCAAGGGACCTGTCCGTCATTACCTATTGTACTTCAAGAGTCTCATGGTATGAAGAAGAGTTCCGAGAAGTAGTTTCGCTTAGTGACTCGGTGTCCAACCGCCCTCTCTCAGATAGTCATTCTGGACCTAGTGTCGGTGACGGTGTCCACGGTAGCGGCCCGGTAGGTGGTATGCCCCAGGCATGCTAGGGCATCCGGTAAATTCAAGAGTGACCGGTTCGCGATTGATGGCCAAGACCAGGATGTACTAATGTCGAGTCGGACTCATG',12)
soln = de_bruijn_graph_from_string(*input)
write_temp(format_dict(soln))
print_sep("De Bruijn Graph from k-mers")
print("""Construct the de Bruijn graph from a set of k-mers.
Input: A collection of k-mers Patterns.
Output: The adjacency list of the de Bruijn graph DeBruijn(Patterns).""")
input = (['TGTTTCCCTCTTTTACTTCA','GGGATTTAGGGTGCGTGGAT','ATGGGCTCCTCGTACGCTTC','ACGGCAGTCGGACTTACGGA','ATCGCGGGTTGTCGAGATCC','GGGAAGAGCGTCATCAGATC','TCGACCGCATCAGGGCGGGT','TGGCTTGACCGACGAAATTA','ACAATGGCCGAAACTCCCAT','CACTAGGGTCTGAGTATCGC','GTTTCAAATTTCCTGTTATA','GTAGATCCAGCTCACCTCTA','AATGGGCTCCTCGTACGCTT','AACGTGCAGTGGTGCGACAG','TCAAAAATGATTGGTCCTAT','TAGATCCACGCGAAGACGCC','TCTAGACGCGAGTCAATCGT','TCACACGTGAGAAGTGGCTG','CCCGGAACGCCTACGGCAGT','CAGGCTGCGTAGATCCAGCT','ATTTGACGGGGTTTTTGATC','GTATGCACTAGGGTCTGAGT','CCTGAAGCCCATTTTCGACC','GGGTTGTCGAGATCCTGAGA','AGGCTGCGTAGATCCATGAC','TACCTGAAGCCCATTTTCGA','TGGGTTATTTGCCAAAGGGT','AACTCTAGCTATGGATACTT','ACTAGGAATCTGCCGAGCTC','GAGCTGGTATTTGACGGGGT','TTTCCTGTTATACACGGGGT','ATTTGCCAAAGGGTCCCTTA','CTCAGTTACCGTAATTAAAA','TGAGTAAGAGAGCGGCAGGC','GCAAATGGGCTCCTCGTACG','CCCGATTGACGCCGCTTCAT','TCAACTTCAAAGTTAGTGGC','ATTGGGAACCATGTGGGTTA','TTACCGTAATTAAAAGTAAT','CATGTCTCTGGCTCTGAAGC','ATCCCTAGGGCAAGACTTTT','TGGCCGAAACTCCCATGCCA','TCGTACGCTTCGTGCGGGCG','TCCTATGGGGCTAGTTCGTG','CAGTCGGACTTACGGATACC','TCCCTATTTCCCCCACCGCG','CCCACCGCGACCGTTCATGG','CGCCATGTTAGTAAACTGCA','CCGTAATTAAAAGTAATTGG','CTCCCTATTTCCCCCACCGC','TAAAAGTAATTGGGAACCAT','TCGAAGTCAGGCTGCGTAGA','TACCCTAATGCATCTGGGTA','CATGTTCTTGAGCTGGTATT','TCGGCAGCTAGAATGTCTGC','GGGGACATAACCAAGGTTCT','TCAAAGTTAGTGGCTTGACC','TGGGAACCATGTGGGTTATT','CTTCAACTTCCATTCCGACG','CCCAGGACATTCTAGACGCG','CTAAGGGAAGATCGAGGAAC','TTGGTCCTATGGGGCTAGTT','ATTTAGGGTGCGTGGATCTA','AATAAATGTCGAGGGGTGTC','ACACGGGGTCCTACGTTCAT','TTCAAAGTTAGTGGCTTGAC','CTTCAACTTCGGACACGGTT','ACAAGGAACTATCCGCCCCG','AGGTTTTCTCAGTTACCGTA','TGCGTAGATCCAAGGGATGT','TATGGGGCTAGTTCGTGGGG','TAAGGGGCTTTGTACTGTTA','GTCGAGATCCTGAGATTCTG','CCTTTAAATTACGCGGCCAA','CATTCCGACGTGGATTGACC','CCTAGGGCAAGACTTTTCGT','CGCGCTGCGCGTGACACGAG','ATTTGTCTCCACAAAGCCAC','AAAAGTAATTGGGAACCATG','CGACCCAGGACATTCTAGAC','TATATGCTCAGGCTGCGTAG','CGGGGACGTTGGATTTAATG','ATGCCACCGGCTACAATCAC','GCGGGTTGTCGAGATCCTGA','CCGACGAAATTACAAGCACA','GGCTCTGAAGCGAAGACCCA','ATATGCTCAGGCTGCGTAGA','GCCGAGCTCATCCCCAATTT','AAGTTAGTGGCTTGACCGAC','AATGCTTCCAATGGGAAAAC','CTGGCATAGTTAAAGTCCAT','TAGAATCCCAGTCACAAGAT','GAACGACAAAGGGCGCAAAT','TCGTCATCTCAAAAATGATT','TTACTATGCCTCACACGTGA','TTATTCGATACCCTAATGCA','GTATCGCACGTTCCGGTACG','TAGATCCAAGGGATGTTTCC','ATACACGGGGTCCTACGTTC','GCTAGTTCGTGGGGAAGAGC','ACACCTAAAACGTGCAGTGG','CCATGTTAGTAAACTGCACT','CATGGGTGTAACCAAATGTC','ACCCGCAACTGCCGTAAATT','TGCGTTTCAAATTTCCTGTT','CATGTATGTTGAGTAAGAGA','GCTCTGAAGCGAAGACCCAT','TCACAAGATATAGCGTTCTT','AGGGGCTTTGTACTGTTAGG','GGAAGCCCACTCCCTATTTC','CTCCGGAGAGAGGAGCGCTG','TCCTACGTTCATCGCGGGTT','CGGACACGGTTACTATATGC','TGAGATTCTGCATTGTTCAC','ATCCTGAGATTCTGCATTGT','TCGAATACGCAAATAAATGT','CCCATCAACTGTCTCAGCGA','ACCTAAAACGTGCAGTGGTG','GCTGGTCAGACCACAGCAAG','TGTGGAGTCGGGATTCATAC','CAAAGTTAGTGGCTTGACCG','TGGCTCTTTCGTACATAAGT','ACTTTTAGAGTCTGCCCTCG','GCCCGGTTTAAGTTAAATAA','CCCTCTTTTACTTCAACTTC','CGGGGATAAGGGTAAGCGGA','ATGTTTCCCTCTTTTACTTC','GCCAAAGGGTCCCTTAAAAC','GCGACCCAGGACATTCTAGA','CGGGCCTAATCTGCAGTTAT','GAACCATGTGGGTTATTTGC','CATCAGGGCGGGTCCGACCC','ACTCCGGAGAGAGGAGCGCT','GAATCCCAGTCACAAGATAT','AGGTAGTAGCGCGATACATT','CCTACGGCAGTCGGACTTAC','GTATGTATGCACTAGGGTCT','TTCCTGTTATACACGGGGTC','CACTCCGGAGAGAGGAGCGC','GGTCGGTGGCTCTTTCGTAC','AGATCCTGAGATTCTGCATT','TCGTGCGGGCGACGCGCTGC','GATACCCATCAACTGTCTCA','ATCGTCATCTCAAAAATGAT','AATCTGCCGAGCTCATCCCC','ACATAACCAAGGTTCTAATG','TTACTTCAACTTCAAAGTTA','AGACTTTTCGTATTTGTCTC','ACGCGAGTCAATCGTCATCT','ATACCTGAAGCCCATTTTCG','GCCGTACGGAGTTATCTCAT','ATCTGCCGAGCTCATCCCCA','CATGCCACCGGCTACAATCA','AATAAGCTGCACATACCTGA','GGCCAAGAGGTAGTAGCGCG','CTCAAAAATGATTGGTCCTA','CTCCACAAAGCCACAGTCAA','CTGGCTCTGAAGCGAAGACC','TAAGCAGTCATTGGGACCGG','TCATCGCGGGTTGTCGAGAT','GGTCCCTTAAAACCGTTCTG','CTCTTTTACTTCAACTTCAA','CAGCTCACCTCTACCTCTTT','AAATTACGCGGCCAAGAGGT','TAAGCATCCTCGAACGCTAT','AATTACGCGGCCAAGAGGTA','ATCGAAGTCAGGCTGCGTAG','CAAAGGGTCCCTTAAAACCG','GTTATACACGGGGTCCTACG','TAGCCCGGTTTAAGTTAAAT','CGTTCATGGGTGTAACCAAA','AACCAAATGTCTGCGCGTGG','AGGGTCTGAGTATCGCACGT','TGTTGAGTAAGAGAGCGGCA','AATGTCTGCCGTACGGAGTT','ACGCCGCTTCATCTAGAGTT','GTCTCCACAAAGCCACAGTC','TCTGCCGAGCTCATCCCCAA','GTTAGGTCAGCTGGCATAGT','CATCAGATCACGTGTGGAGT','ATTGACGCCGCTTCATCTAG','CCTAGGGATTTAGGGTGCGT','CGTAGATCCAAGGGATGTTT','GCAGCTGTGGATGGGTGGGG','TACCCATTCAATGATCATGT','GATAAGGGTAAGCGGAAGCC','ACCCATTCAATGATCATGTC','TCTTAGCGCAGGTTTTCTCA','AAGCCAGTACGAGCTGCTAA','AACTGTCTCAGCGACCTGTT','TACCAGAAACATCCCGATTG','TCTTTTACTTCAACTTCGGA','GTAAACTGCACTACCCTGGC','AATACCAAGAGCAGCTAGGT','ATCTGCCTCTTTTACTTCAA','AGCTGTGGATGGGTGGGGTC','CCGGTACGCGCTACATTTCC','ATGGGAAAACTATCATAGCG','TGGGCACAATATCATCGAAG','TTTTGATCGTTGCGTTTCAA','TTCCTCTGGGCACAATATCA','ATTCAACAAGGAACTATCCG','GGGATTCATACGCCGGGGAT','GTGAGCGACCCAGGACATTC','TCGAACGCTATCTGCGTATT','GGCAGGCCGACTAGCGACAG','ACCAAAGATAACGCTCGTGG','GTAAGCGGAAGCCAGTACGA','ATTCTGCATTGTTCACCAAA','GCCTCTTTTACTTCAACTTC','AATACCCATTCAATGATCAT','TACGAGCTGCTAAGGGAAGA','AACCTCCGCAGCTGTGGATG','AAATTACAAGCACATAGAAT','CGGCGCTCGGCAGCTAGAAT','CCTAATCTGCAGTTATCCCT','GAGACTCGAATACGCAAATA','ACAGGA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ATCATGTCCGGCGGAAGCCC','CAAATGGGCTCCTCGTACGC','GGTGCGACAGCGTGGGAGTA','TACTTCAACTTCTTATCATG','GGCTACAATCACGGAAGTCG','GCGCTTCCCACAATGGCCGA','GATATAGCGTTCTTCTTAGC','GCGACGCGCTGCGCGTGACA','CCCATGCCACCGGCTACAAT','TCTCAGCGACCTGTTGCACC','ATCATGTTCTTGAGCTGGTA','CGGCAGCTAGAATGTCTGCC','ACATTTCCTGGTTTAACCTC','ACTCCCTATTTCCCCCACCG','TGTCTCCACAAAGCCACAGT','AGTCGGGATTCATACGCCGG','GGCGCTCGGCAGCTAGAATG','ACATTCTAGACGCGAGTCAA','CTTCGGACACGGTTACTATA','ATACTCATGCAACCCGCAAC','CTGGGTAGTGACTAAGCATC','CTAGGTCGGTGGCTCTTTCG','CTGAAGCGAAGACCCATGTA','GACGTTGGATTTAATGATAC','CTACATGTCTCTGGCTCTGA','ATCCTCGAACGCTATCTGCG','CAGTTACCGTAATTAAAAGT','ACGGGGTCCTACGTTCATCG','GTCTCAGCGACCTGTTGCAC','CTCCTCGTACGCTTCGTGCG','GCACATAGAATCCCAGTCAC','GTACATAAGTGAGCGACCCA','ACTGCACTACCCTGGCGAGA','GGATACCCATCAACTGTCTC','TCCCACAATGGCCGAAACTC','CTTCTTATCATGTTCTTGAG','GCGGAAGCCCACTCCCTATT','TCGATACCCTAATGCATCTG','GGAAGTCGTGCGTTCTTACT','ATTACAAGCACATAGAATCC','AGTCTGCCCTCGGGGGCTTG','ACATGTAGCCCGGTTTAAGT','AGCTGGCATAGTTAAAGTCC','CAATGGGAAAACTATCATAG','CAATACCCATTCAATGATCA','CCGGCGGAAGCCCACTCCCT','CCATTTTCGACCGCATCAGG','TAACCTCCGCAGCTGTGGAT','CCGGCTACAATCACGGAAGT','AATGATTGGTCCTATGGGGC','GGAACGACAAAGGGCGCAAA','CCAAATGTCTGCGCGTGGAG','AACCAAGGTTCTAATGCTTC','AATGTCTGCGCGTGGAGGGT','GTTCTTACTATGCCTCACAC','TGCCTCACACGTGAGAAGTG','TCTACGGGCCTAATCTGCAG','CACCACGCTACGCGTATGTA','CGGTGGCTCTTTCGTACATA','GGCGACGCGCTGCGCGTGAC','CGTAAATTAAGCAGTCATTG','CGTTCATCGCGGGTTGTCGA','TAGGAATCTGCCGAGCTCAT','CTAGACGCGAGTCAATCGTC','ACCACAGCAAGGGCTGGCTA','ACTATATGCTCAGGCTGCGT','TGCCCTCGGGGGCTTGAAAG','CTTTCGTACATAAGTGAGCG','GGAACCATGTGGGTTATTTG','ACTCCCATGCCACCGGCTAC','CACCGGCTACAATCACGGAA','CAGGGCGGGTCCGACCCGTT','AGTCCATCATTCCTGGGTAG','GGAGAGAGGAGCGCTGACCA','AGGAACACTCCGGAGAGAGG','GTGACTAAGCATCCTCGAAC','TCGGGGGCTTGAAAGCGCTT','GTGTCCACACCTAAAACGTG','GTAGATCCACGCGAAGACGC','TCCGGAGAGAGGAGCGCTGA','GCGTGGGAGTACCTACTCGT','TGCGCGTGACACGAGAGACT','TGCAGTGGTGCGACAGCGTG','ACCTCCGCAGCTGTGGATGG','TCGATCAGGCTGCGTAGATC','TCACGGAAGTCGTGCGTTCT','ATACGCCGGGGATAAGGGTA','AGTCACAAGATATAGCGTTC','TCTGCCTCTTTTACTTCAAC','GCTTCCCACAATGGCCGAAA','ACCGTTCATGGGTGTAACCA','GTTTAAGTTAAATAAGCTGC','ATAAGCTGCACATACCTGAA','AGGCTGCGTAGATCCACGCG','GGATTTAATGATACCAGAAA','AGACTCGAATACGCAAATAA','CGATACCCTAATGCATCTGG','GTAACCAAATGTCTGCGCGT','GTGGATCTACTCGATCAGGC','TTACGGATACCCATCAACTG','ATCTCAAAAATGATTGGTCC','CACCTAAAACGTGCAGTGGT','TCATCGAAGTCAGGCTGCGT','AAGGTTCTAATGCTTCCAAT','TGTCCGGCGGAAGCCCACTC','ATTCGATACCCTAATGCATC','TTTACTTCAACTTCCATTCC','GTTCAGGCTGCGTAGATCCA','AATGCAAGTCCTGGATTAAA','AGCTCATCCCCAATTTCCAC','TACGCGTATGTATGCACTAG','CTCGATCAGGCTGCGTAGAT','GGTTCTAATGCTTCCAATGG','GGGTCAGTTAATAAAGTTAA','TTCCTGGTTTAACCTCCGCA','CAACTGTCTCAGCGACCTGT','CTACGGCAGTCGGACTTACG','TCTTTTACTTCAACTTCCAT','AAGACTTTTCGTATTTGTCT','GTGGGTTATTTGCCAAAGGG','GGAGTCGGGATTCATACGCC','CGCGAGTCAATCGTCATCTC','GGTCCGACCCGTTAATTCAA','CAATGGCCGAAACTCCCATG','CCCTAATGCATCTGGGTAGT','GATTCATACGCCGGGGATAA','CCGATTGACGCCGCTTCATC','CCAAAGGGTCCCTTAAAACC','TGTTCACCAAAGATAACGCT','TGCCGTACGGAGTTATCTCA','GAAGAGCGTCATCAGATCAC','CACGTTCCGGTACGCGCTAC','TACATGTCTCTGGCTCTGAA','GCTGACCACTATGTAGTACG','CAGGCCGACTAGCGACAGGA','CTACACCACGCTACGCGTAT','ACACTCCGGAGAGAGGAGCG','AGCAGTCATTGGGACCGGGG','CTCTTTTACTTCAACTTCTT','AACGCTCGTGGGGCTAAGGG','TGTCTGCCGTACGGAGTTAT','GGAAAACTATCATAGCGGAA','TTAAGCAGTCATTGGGACCG','GTCTGCCCTCGGGGGCTTGA','AGTACCTACTCGTTTGGGGC','TGGATACTTTTAGAGTCTGC','TCGAGATCCTGAGATTCTGC','GAGTAAGAGAGCGGCAGGCC','GATCTGCCTCTTTTACTTCA','TGGCGAGAACCTCTACGGGC','TGGCATAGTTAAAGTCCATC','ATGGGTGTAACCAAATGTCT','TGGGAGTACCTACTCGTTTG','TCCGACCCGTTAATTCAACA','TTCAACTTCAAAGTTAGTGG','CTCTAGCTATGGATACTTTT','GTTAAAGTCCATCATTCCTG','TTCGGACACGGTTACTATAT','CGATCAGGCTGCGTAGATCC','GGTTTTCTCAGTTACCGTAA','GCGATTGTTCCTCTGGGCAC','AAGCGAAGACCCATGTATGT','TTCGACCGCATCAGGGCGGG','GAAAGCGCTTCCCACAATGG','TTCTTACTATGCCTCACACG','TTCATCGCGGGTTGTCGAGA','CTCTTTTACTTCAACTTCCA','GAAACCCAATACCCATTCAA','ATGCTCAGGCTGCGTAGATC','GTAGTACGCCTTTAAATTAC','ATGTCGAGGGGTGTCCACAC','GTTGGATTTAATGATACCAG','GTGGGAGTACCTACTCGTTT','ATAAAGTTAATACCAAGAGC','GAAGACCCATGTATGTTGAG','GGATCTACTCGATCAGGCTG','TATGTTGAGTAAGAGAGCGG','AGTTACCGTAATTAAAAGTA','CCCATTCAATGATCATGTCC','AAAACTCTAGCTATGGATAC','TACGGAGTTATCTCATGTCC','AGCACATAGAATCCCAGTCA','GAAGATCGAGGAACGACAAA','GAGTATCGCACGTTCCGGTA','GTACGAGCTGCTAAGGGAAG','AAACTGCACTACCCTGGCGA','TTGGTTTATGCGATTGTTCC','CTCGAACGCTATCTGCGTAT','TGGATGGGTGGGGTCAGTTA','TACTCGTTTGGGGCTTACGG','GACCTGTTGCACCCATACTC','TTCCACACGGCTACATGTCT','AACCCAATACCCATTCAATG','GGACTTACGGATACCCATCA','ACGGCTACATGTCTCTGGCT','AAGATAACGCTCGTGGGGCT','TTTCTCAGTTACCGTAATTA','ACATGTCTCTGGCTCTGAAG','GGGCCTAATCTGCAGTTATC','TATGCGATTGTTCCTCTGGG','CAAGAGCAGCTAGGTCGGTG','AAATAAGCTGCACATACCTG','TCAACAAGGAACTATCCGCC','CCAAGGTTCTAATGCTTCCA','CTTTTACTTCAACTTCAAAG','TGGTCCTATGGGGCTAGTTC','AGTTCGTGGGGAAGAGCGTC','AGGGTAAGCGGAAGCCAGTA','CAACTTCAAAGTTAGTGGCT','AAGAGAGCGGCAGGCCGACT','ACCACGCTACGCGTATGTAT','TTCTCAGTTACCGTAATTAA','TGTAGCCCGGTTTAAGTTAA','GATTGACCATTTATTCGATA','CAGACCACAGCAAGGGCTGG','GTATTTGACGGGGTTTTTGA','TATACACGGGGTCCTACGTT','ATGATACCAGAAACATCCCG','CCGAGCTCATCCCCAATTTC','GCAGCTAGAATGTCTGCCGT','AAAAAACTCTAGCTATGGAT','ACTATCATAGCGGAAATGCA','GTAGCGCGATACATTGGTTT','ACCCTGGCGAGAACCTCTAC','CATTTTCGACCGCATCAGGG','CTAAGCATCCTCGAACGCTA','TTCTTCTTAGCGCAGGTTTT','TCCGGTACGCGCTACATTTC','ATTGGTCCTATGGGGCTAGT','ACCTACTCGTTTGGGGCTTA','CGACGCGCTGCGCGTGACAC','CCGACGTGGATTGACCATTT','TCTTACTATGCCTCACACGT','ACAAGATATAGCGTTCTTCT','CCTAAAACGTGCAGTGGTGC','TAATTGGGAACCATGTGGGT','AGAGCAGCTAGGTCGGTGGC','AGCGCTTCCCACAATGGCCG','ATGCATCTGGGTAGTGACTA','ATGTTGAGTAAGAGAGCGGC','TAAAGTCCATCATTCCTGGG','CTTAGCGCAGGTTTTCTCAG','ATTCCTGGGTAGTGCCTAGG','AACTTCGGACACGGTTACTA','CTACCCTGGCGAGAACCTCT','CCTGTTATACACGGGGTCCT','TACGCTTCGTGCGGGCGACG','GCTCAGGCTGCGTAGATCCA','GACTAAGCATCCTCGAACGC','GATCCAGCTCACCTCTACCT','TGTCGAGATCCTGAGATTCT','AGTGGCTGGTCAGACCACAG','CACAATGGCCGAAACTCCCA','ACGCCTTTAAATTACGCGGC','GGCGCAAATGGGCTCCTCGT','GACACGAGAGACTCGAATAC','GAGCGGCAGGCCGACTAGCG','AGGGCTGGCTACACCACGCT','CTCGTTTGGGGCTTACGGCG','CTGTTGCACCCATACTCATG','GGAACACTCCGGAGAGAGGA','ACGCGGCCAAGAGGTAGTAG','CTAGGGTCTGAGTATCGCAC','TTGTTCCTCTGGGCACAATA','CGCCGGGGATAAGGGTAAGC','CTTTGTACTGTTAGGTCAGC','CGCAAATAAATGTCGAGGGG','ATGCCTCACACGTGAGAAGT','AATTCAACAAGGAACTATCC','ACATTGGTTTATGCGATTGT','GTCTGCCGTACGGAGTTATC','CTACTCGATCAGGCTGCGTA','GTTCTTGAGCTGGTATTTGA','AGTAGCGCGATACATTGGTT','CCCTGGCGAGAACCTCTACG','CCTATTTCCCCCACCGCGAC','CTAGTTCGTGGGGAAGAGCG','GAGAGACTCGAATACGCAAA','GCACATACCTGAAGCCCATT','GAGGAGCGCTGACCACTATG','GCGCAAATGGGCTCCTCGTA','TTAAAAAAACTCTAGCTATG','TCGTGCGTTCTTACTATGCC','GGCCGACTAGCGACAGGAAC','AGGACATTCTAGACGCGAGT','GCAGTCATTGGGACCGGGGA','TCTGCGCGTGGAGGGTCACT','ATAGAATCCCAGTCACAAGA','TCAGGCTGCGTAGATCCAGC','CGACCGCATCAGGGCGGGTC','GAAATTACAAGCACATAGAA','CCTCTTTTACTTCAACTTCC','GAGCGACCCAGGACATTCTA','AGCTAGAATGTCTGCCGTAC','GACAGCGTGGGAGTACCTAC','CGGCGGAAGCCCACTCCCTA','TCAACTTCGGACACGGTTAC','AAGCATCCTCGAACGCTATC','AGGAACGACAAAGGGCGCAA','TGAAGCCCATTTTCGACCGC','AGCGTGGGAGTACCTACTCG','CTCACCTCTACCTCTTTTAC','GCCACAGTCAAGTCATGGCG','GCGTAGATCCATGACCGATC','ACGCCGGGGATAAGGGTAAG','ACCATGTGGGTTATTTGCCA','CCTTAAAACCGTTCTGCCGC','TGCGTTCTTACTATGCCTCA','TACATTGGTTTATGCGATTG','ACACGGTTACTATATGCTCA','GCCGTAAATTAAGCAGTCAT','TTCAGGCTGCGTAGATCCAT','TTTTACTTCAACTTCTTATC','TAAGGGTAAGCGGAAGCCAG','TAATACCAAGAGCAGCTAGG','GCGTGGATCTACTCGATCAG','GGATTCATACGCCGGGGATA','CAGTCAAGTCATGGCGAAAC','TGATACCAGAAACATCCCGA','CAGTCACAAGATATAGCGTT','AAGGGATGTTTCCCTCTTTT','GCAAGACTTTTCGTATTTGT','CATTGGGACCGGGGACGTTG','CTGCCGAGCTCATCCCCAAT','ACCCAGGACATTCTAGACGC','GCCTACGGCAGTCGGACTTA','CCAATGGGAAAACTATCATA','CATTGTTCACCAAAGATAAC','TACACCACGCTACGCGTATG','TCATGGGTGTAACCAAATGT','GGCGGAAGCCCACTCCCTAT','GAGCTGCTAAGGGAAGATCG','GGGGGCTTGAAAGCGCTTCC','CTGTCTCAGCGACCTGTTGC','ACGCTTCGTGCGGGCGACGC','AACAAGGAACTATCCGCCCC','TTTTTGATCGTTGCGTTTCA','TTTATGCGATTGTTCCTCTG','TGATCATGTCCGGCGGAAGC','AAGGGTCCCTTAAAACCGTT','ACAGCAAGGGCTGGCTACAC','TGGCGAAACCCAATACCCAT','GCTCACCTCTACCTCTTTTA','CGCACGTTCCGGTACGCGCT','TTTCGACCGCATCAGGGCGG','GACCGGGGACGTTGGATTTA','CGCGATACATTGGTTTATGC','TGGTTTATGCGATTGTTCCT','TTACAAGCACATAGAATCCC','TACTATATGCTCAGGCTGCG','GAGAGAGGAGCGCTGACCAC','CTTTTACTTCAACTTCTTAT','TTATACACGGGGTCCTACGT','CACACCTAAAACGTGCAGTG','CAAAGGGCGCAAATGGGCTC','AGAAGTGGCTGGTCAGACCA','ATAAGTGAGCGACCCAGGAC','GCGCGATACATTGGTTTATG','ATACATTGGTTTATGCGATT','ACGGAGTTATCTCATGTCCA','TTTATTCGATACCCTAATGC','ATGTTAGTAAACTGCACTAC','GATCCACGCGAAGACGCCCT','CTAAGGGGCTTTGTACTGTT','CGACCGTTCATGGGTGTAAC','GTACGGAGTTATCTCATGTC','TAAGGGAAGATCGAGGAACG','GGACCGGGGACGTTGGATTT','AGGAATCTGCCGAGCTCATC','TCCGCAGCTGTGGATGGGTG','GCGGAAATGCAAGTCCTGGA','ACGAGCTGCTAAGGGAAGAT','CTTTTACTTCAACTTCGGAC','GCATAGTTAAAGTCCATCAT','GCGTGACACGAGAGACTCGA','CCGGTTTAAGTTAAATAAGC','CTACGTTCATCGCGGGTTGT','CTGACCACTATGTAGTACGC','TGCAGTTATCCCTAGGGCAA','TCTCATGTCCACATGTAGCC','ATCCGCCCCGGAACGCCTAC','TGTTAGTAAACTGCACTACC','GCGACCTGTTGCACCCATAC','ATGATCATGTCCGGCGGAAG','GATTCTGCATTGTTCACCAA','AGGGGTGTCCACACCTAAAA','AGATCCATGACCGATCTGCC','AAACTATCATAGCGGAAATG','AGTTAATAAAGTTAATACCA','CCGCAGCTGTGGATGGGTGG','GAAATGCAAGTCCTGGATTA','TAAGAGAGCGGCAGGCCGAC','GCGGGTCCGACCCGTTAATT','TCGAGGAACGACAAAGGGCG','TCGTATTTGTCTCCACAAAG','CCAATACCCATTCAATGATC','TAGATCCAGCTCACCTCTAC','CAGTCATTGGGACCGGGGAC','ACGGTTACTATATGCTCAGG','TGGGTGGGGTCAGTTAATAA','GTAGATCCATGACCGATCTG','CTCACACGTGAGAAGTGGCT','GATGTTTCCCTCTTTTACTT','CTGCATTGTTCACCAAAGAT','TCGTGGGGCTAAGGGGCTTT','GGGATAAGGGTAAGCGGAAG','CTGCACATACCTGAAGCCCA','CTGCCGCCATGTTAGTAAAC','TGGGACCGGGGACGTTGGAT','GTCTCTGGCTCTGAAGCGAA','GCGCTGCGCGTGACACGAGA','GCTTCCAATGGGAAAACTAT','GGGCTAAGGGGCTTTGTACT','GGCATAGTTAAAGTCCATCA','ATGTCCACATGTAGCCCGGT','TCAATCGTCATCTCAAAAAT','TACGCAAATAAATGTCGAGG','TGCCAAAGGGTCCCTTAAAA','GGGAAAACTATCATAGCGGA','CACGTGTGGAGTCGGGATTC','GTTACTATATGCTCAGGCTG','GCGTGGAGGGTCACTAGGAA','GTTCACCAAAGATAACGCTC','GATACCCTAATGCATCTGGG','CATCCCCAATTTCCACACGG','TTCAACTTCCATTCCGACGT','GTTATCTCATGTCCACATGT','GAACGCCTACGGCAGTCGGA','GCAGCTAGGTCGGTGGCTCT','TCCCTAGGGCAAGACTTTTC','CGACAGCGTGGGAGTACCTA','TCCGACGTGGATTGACCATT','GACACGGTTACTATATGCTC','TAGAATGTCTGCCGTACGGA','ACACGTGAGAAGTGGCTGGT','GCCTTTAAATTACGCGGCCA','GGGCTCCTCGTACGCTTCGT','GACGTGGATTGACCATTTAT'],)
soln = de_bruijn_graph_from_kmers(*input)
print(format_dict(soln))
write_temp(format_dict(soln))
def test_string_composition():
input = ('CAATCCAAC',5)
output = string_composition(*input)
assert sorted(output) == sorted(["CAATC","AATCC","ATCCA","TCCAA","CCAAC"])
print(c("GREEN","PASSED"))
def test_kmer_path_to_string():
path = ['ATG', 'TGC', 'GCA']
assert kmer_path_to_string(path) == 'ATGCA'
path = ['ACCGA','CCGAA','CGAAG','GAAGC','AAGCT']
assert kmer_path_to_string(path) == 'ACCGAAGCT'
def test_overlap_graph():
input = (['ATGCG','GCATG','CATGC','AGGCA','GGCAT','GGCAC'],)
output = overlap_graph(['ATGCG','GCATG','CATGC','AGGCA','GGCAT','GGCAC'])
assert output == {'GCATG': ['CATGC'], 'CATGC': ['ATGCG'], 'AGGCA': ['GGCAT', 'GGCAC'], 'GGCAT': ['GCATG']}
def test_de_bruijn_graph():
input = ("AAGATTCTCTAAGA", 4)
output = de_bruijn_graph_from_string(*input)
assert output == {'AAG': ['AGA', 'AGA'], 'AGA': ['GAT'], 'GAT': ['ATT'], 'ATT': ['TTC'], 'TTC': ['TCT'], 'TCT': ['CTC', 'CTA'], 'CTC': ['TCT'], 'CTA': ['TAA'], 'TAA': ['AAG']}
def test_de_bruijn_graph_from_kmers():
input = (['GAGG','CAGG','GGGG','GGGA','CAGG','AGGG','GGAG'], 4)
output = de_bruijn_graph_from_kmers(*input)
assert output == {'GAG': ['AGG'], 'CAG': ['AGG', 'AGG'], 'GGG': ['GGG', 'GGA'], 'AGG': ['GGG'], 'GGA': ['GAG']}
#print(output)
if __name__ == '__main__':
sys.exit(pytest.main(["-s", "pt2_week1.py::test_week1"])) #-s to not suppress prints