안녕하세요. 논문과 코드를 흥미롭게 잘 읽었습니다.

[kanelian63]

안녕하십니까.

신약개발과 관련해서 열심히 공부중인 사람입니다.

작성하신 논문과 코드를 아주 흥미롭게 잘 읽었습니다. 정말 참신한 아이디어와 모델인듯합니다.

논문과 코드를 읽다보니 조금 궁금한 점이 있어서 이렇게 연락드리게 되었습니다.

data 폴더의 파일들이 확장자가 없는 pkl파일들이던데 이 데이터를 어떻게 만드신지 궁금합니다.

PDB나 Dud-E 데이터를 전처리하여 이 파일을 만드는 코드가 혹시 올려놓으신 파일들에 포함되어 있는지 궁금합니다. 만약 코드가 올려놓으신 데이터에 포함되어 있다면 위치를 좀 알려주실 수 있으신가요? 혹시 없다면, 어떤 데이터로 어떻게 전처리하신지 좀 알려주실 수 있으신지요?

논문 정말 감사히 잘 읽었습니다.

답변 기다립니다.

[jaechanglim]

전처리 코드는 따로 올려두지 않았습니다. pickle file format이고 protein과 ligand 2개의 rdkit object의 tuple입니다. (m1,m2) m1: ligand rdkit object, m2: protein rdkit object 이런식으로 되어 있습니다