Skip to content

Latest commit

 

History

History
187 lines (112 loc) · 6.54 KB

WB.md

File metadata and controls

187 lines (112 loc) · 6.54 KB
title date-modified categories toc
蛋白质印迹(Western Blotting,WB)
today
protocols
immune
true

蛋白质免疫印迹(protein immunoblotting)

试剂和仪器

试剂

  1. PBS
  2. 高效RIPA裂解液(lysis buffer),-4℃
  3. WB及Co-Ip裂解液,-20℃
  4. 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合液 http://www.ncmbio.com/product/show-138.html:-20℃,1: 100,
  5. BCA工作液:A液:B液= 50:1 苹果绿色
  6. 5 × loading buffer
  7. 电泳缓冲液
  8. 转膜缓冲液:700ml $ddH_2O$ : 200ml 甲醇 :100ml 10×转膜液 ,4℃冰箱预冷
  9. 1×TBST:1L ddH2O+ 10×TBS粉,取400ml定容至4L,[枪头剪去尖端,加入4ml Tween20,连枪头一起打入]{style="color:red"},得到 1× TBST
  10. 封闭液:5%脱脂奶粉TBST溶液,2.5g奶粉+50mlTBST,
  11. 一抗、一抗稀释液、二抗、二抗稀释液
  12. 显影液:A液,B液

仪器

恒温摇床、冷冻离心机 参数 转速 半径、96孔酶标板

实验操作

蛋白提取

[所有溶液均应预冷,所有步骤应于冰上/4℃ 进行]{style="color:red"}

i. 将传代细胞培养皿放于冰上,弃去培养基,用预冷的PBS洗涤细胞3遍

<mark>细胞来源:动物信息、编号、性别、年龄、体重、清洁度、细胞株、基因信息</mark>

ii. 用纯水洗涤细胞刮

iii. 酶抑制剂: RIPA lysis=1;100 混合,加入培养皿,用细胞刮轻轻刮取细胞

iv. 充分裂解后,混合泳转移至1.5mL离心管

冷冻离心机4℃预冷,以14000g离心10min,分装上清到 至少2个新的1.5mL离心管。 [样品所有人姓名,样品制备或分装年月日,全部基本信息(批号、纯度、浓度)]{style="color:red"} 例如:AlexFluoro647-G3-(GfO)9,365 uM in ddH2O by UV@647nm,95%(MALDI),LY,2021.07.21

::: callout-tip 离心力F=m ω^2^ R 重力G=mg

相对离心力RCF =F/G = r ω^2^ /g =1.118×10^-5^ × r × rpm^2^

  • 相对离心力(relative centrifugal force,RCF),一般以g(重力加速度)的倍数来表示,g=9.801 m/s^2^ = 980.10 cm/s^2^

  • r为离心机转子半径,单位cm

  • $\omega=\frac{2\pi n}{60}$

{width="50%"} :::

BCA法蛋白定量

::: callout-note 二辛可宁酸/二喹啉甲酸(bicinchoninic acid,BCA)

① protein + Cu^2+^ (碱性) → Cu^+^

② Cu^+^ + 2BCA → 紫色络合物 OD562 :::

  1. 96孔酶标板,2mg/mL BSA标准曲线

    {width="50%"}

  2. 每孔加入200 μL BCA工作液,梯度BSA蛋白,用ddH2O稀释10倍的样本蛋白

  3. 恒温37℃孵育30min 具体:恒温孵育 9日11:34至12:05

  4. 提前打开的酶标仪,ABS,562nm 具体:在562nm的紫外吸收(A1+A2+A3)/3=A平均

  5. 计算样品蛋白浓度 c (μg/μL)

蛋白变性

  1. 之前分装的样品protein:5×loading buffer=4:1稀释
  2. 95℃加热5分钟,冷却至室温

电泳

(低温,冰盒,电泳槽)[4℃]{style="color:red"}

  1. 计算上样量体积V (μL),m=V × c × 10 × 4/5,$V=\frac{上样量(μg)}{c×8}$,单孔上样每次不超过20μL,总蛋白20-50μg,纯化蛋白100ng-2μg
  2. 预制胶,撕掉底部的红色封条
  3. 电泳液 MOPS+ 1L ddH2O,外槽用旧的达到下方刻度,内槽用新的加满至溢出,新的回收下次利用
  4. 缓慢垂直向上拔出点样梳,将上样孔的气泡赶尽
  5. 10微升移液器紧贴玻璃板缓慢上样,marker,从左到右依次减少
  6. (可选)阳性对照(前期检测结果正确的多余的蛋白质),阴性对照
  7. 连接电泳装置红对红,黑对黑,接通电源恒压100-140V,60min,内槽金属丝周围出现小气泡

湿法转膜

硝酸纤维素(NC)膜和聚偏二氟乙烯(PVDF)膜,[4℃]{style="color:red"}冰袋

  1. 根据凝胶大小,剪切PVDF膜成适宜大小

    1. PVDF膜活化:甲醇帮助蛋白结合到膜上,膜由不透明变成均一的版透明,然后将膜放入提前配好的预冷的转膜液中平衡5min,边角剪切一部分标记以区分正反方向,使转膜后呈现 @fig-膜

      {#fig-膜 width="50%"}

  2. 电泳后的凝胶用水冲洗去电泳液,再用转膜液平衡3-5min

  3. 用硬塑料片撬开一面玻璃板,切除浓缩胶,留下含有目的蛋白的凝胶

  4. 转膜夹,海绵垫,滤纸,浸没在含有转膜液的托盘中,三明治结构(黑色负极)黑色面,海绵垫,滤纸,凝胶(上面朝闭合处),PVDF膜,滤纸,海绵垫,白色面(红色正极),黑胶白膜

    {width="65%"}

  5. 流式管滚动赶尽气泡,用白色滑块夹上转膜夹

  6. 转移夹的黑面对转移槽的黑面,转移夹的白面对转移槽的白面

  7. 转膜槽中加入转膜液至没过”三明治“,盖上安全盖,放置冰盒

  8. 连接电泳装置红对红,黑对黑,接通电源恒流280mA,60-90min,

封闭

  1. PVDF膜放入TBST溶液,摇床50转速 振荡洗涤5min×3次

  2. 蛋白面向上,5%脱脂奶粉TBST溶液,2.5g奶粉+50mlTBST,回收-20℃

  3. 摇床50,室温1h或4°C过夜

  4. TBST洗涤,3min×3

    {width="50%"}

一抗孵育

特异性抗体 anti-内参,anti-目的蛋白

::: callout-tip 阳性对照(内部参照loading control 如 β-actin、GAPDH 或阳性血清);

阴性对照(测血时用相应小鼠未免疫血清(即正常血);

基因空载empty vector

基因过表达over expression

空白对照(不加一抗,用 PBS 代替);

无关对照(用无关抗体)。 :::

  1. 塑料手套覆盖,根据分子量kD切割膜上的目的蛋白
  2. 一抗稀释液1:1000
  3. 蛋白面向上,摇床50,4℃过夜
  4. TBST洗涤,摇床100,3min×3

二抗孵育

碱性磷酸酶、辣根过氧化物酶或放射性核素标记的第二抗体

  1. 二抗稀释液1:4000~5000
  2. 摇床50,室温1h
  3. TBST洗涤,摇床100,5min×3

显影

  1. 配制显影液,A luminol: B H2O2=1:1
  2. 软夹镊子转移 膜
  3. 显影仪 电脑文件夹数据图像命名:姓名日期参数Marker/Samples 结果:具体数值/图像/现象/颜色

推荐阅读

  1. http://lsi.zju.edu.cn/2020/0210/c45388a1959437/page.htm

  2. 什么是TBS、TBST、PBS、PBST缓冲液有什么区别?

奇偶页法

左边写实验设计 假设 对照 原始数据 草图 现象

右边正式步骤 数据 分析