Detecção de estagios do sono utilizando aprendizado de maquina

Projeto de iniciação científica
Campus: UTFPR - Pato Branco
Orientador: Jefferson T. Oliva
Curso: Engenharia de Computação.

Obs: Esse repositório é a atualização de outro repositório já existente em minha conta (SleepStageDetection).

Feito

• Download da base de dados Sleep-EDF através do pacote MNE (https://mne.tools/dev/install/index.html).
• Separando os dados por fases do sono.
• Remoção de leituras invalidas.
• Utilizando a biblioteca sfe (ainda não publicada, autoria: Jefferson T. Oliva) para a extração de características.
• Remoção de todas colunas do DataFrame de caracteristicas que possum algum valor NaN
• Armazena as caracteristicas extraidas na pasta Features (Obs: nomes seguem esse formato "./Features/{subject_code}N{night}_{sample_length}_{frequency_sample}.csv").
• Testando classificadores no tipo neighbors e ensemble
• Pontuação dos classificadores salvos na pasta "./Scores"
• Implementação do balanceamento dos dataframes
• Implementar classificação binária
• Comparar com multiclasse
• Agrupar amostras por idade
• Comparar com as classificações feitas com uma unica amostra

A Fazer

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Erros:

• line length: all nan
• nonlinear energy: all nan
• Hurst expoent: all nan
• Shannon entropy: all nan
• Renvi entropy: all nan

Erros resolvidos

• Durante os testes dos classificadores tipo neighbors e ensemble algumas colunas do dataframe apresentaram erros:
  • 'sample_entropy_PS_Gama_EEG Fpz-Cz'
  • 'sample_entropy_PS_Entire_EEG Pz-Oz'
  • 'sample_entropy_PS_Entire_EEG Fpz-Cz'
  • 'sample_entropy_TS_Entire_EEG Fpz-Cz'
  • 'sample_entropy_PS_Gama_EEG Pz-Oz'
  • 'sample_entropy_TS_Entire_EEG Pz-Oz'
  Problema encontrado: por padrão o pandas não considera inf e -inf como NaN
  Solução: pandas.options.mode.use_inf_as_na = True

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Fases do sono

Fase	Representante
Awake	0
Stage 1	1
Stage 2	2
Stage 3	3
Stage 4	4
Rem	5
Undefined	-1

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Características Extraidas

Série Temporal

Banda	Qtd. de características
Inteiro	27
Total	27

Espectro de potência

Banda	Qtd. de características
Delta	29
Theta	29
Alpha	29
Beta	29
Gamma	29
Inteiro	29
Total	174

Espectrograma

Banda	Qtd. de características
Delta	16
Theta	16
Alpha	16
Beta	16
Gamma	16
Inteiro	16
Total	96

Obs: No total 297 características