-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 87
New issue
Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.
By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.
Already on GitHub? Sign in to your account
add InputData from pd and numpy #1184
Conversation
Codecov Report
@@ Coverage Diff @@
## master #1184 +/- ##
==========================================
- Coverage 79.55% 79.50% -0.06%
==========================================
Files 145 145
Lines 9995 10021 +26
==========================================
+ Hits 7952 7967 +15
- Misses 2043 2054 +11
|
fedot/core/data/data.py
Outdated
target_array: np.ndarray, | ||
idx: Optional[np.ndarray] = None, | ||
task: Task = Task(TaskTypesEnum.classification), | ||
data_type: Optional[DataTypesEnum] = None) -> InputData: |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Думаю по умолчанию можно поставить table, как наиболее часто используемый тип
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Может даже стоит создать два метода
from_numpy
и
ts_from_numpy
Интуитивно, пользователю, будет понятней сразу из названия метода, что он может с его помощью конвертировать временной ряд в инпут дату (вместо того, чтобы вручную прописывать Task и DataType)
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Да, по аналогии с from_csv прописала
fedot/core/data/data.py
Outdated
|
||
@classmethod | ||
def from_dataframe(cls, | ||
df: pd.DataFrame, |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Иногда возникает ситуация, когда у тебя X и y - отдельные датафреймы, и хочется создать инпут дату из них. Это выглядит как частный случай метода from_numpy. Возможно его можно обобщить и до датафреймов
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
ну тут идея как раз в том, что пользователь уже пооткрывал свои данные и подготовил датафрейм самостоятельно, специально из этого метода убрала всю автоматичность
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Может быть у меня замыленный взгляд - привык, что в sklearn ты всегда передаешь X и y отдельно. Поэтому часто возникает именно такая ситуация, что хочется отдельно прокинуть фичи и таргет. Но тот вариант, что сейчас написан, тоже нужен.
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Про отдельные X и Y спорный момент. С одной стороны, мы идеологически предлагаем решение "из коробки" - вы просто читаете любой формат в DataFrame и засовываете в AutoML. С другой, почти любая предобработка данных пользователем выдаст X и Y отдельно.
Я считаю, этот вопрос можно переформулировать так: мы рассчитываем на продвинутого пользователя или наоборот?
Судя по тому, что дело дошло до создания InputData вручную, скорее на продвинутого. Тогда, на мой взгляд, разумнее использовать вариант с отдельными параметрами для X и Y.
UPD: На это можно посмотреть ещё так: в pandas гораздо интуитивнее разделяется датафрейм, чем два датафрейма сшиваются воедино. Гораздо лучше, если наш интерфейс не будет никого обрекать на конкатенацию датафреймов.
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Принято, разделила from_dataframe на два входа features_df и target_df
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Отлично, так гораздо удобнее, чем импортировать отдельную функцию.
fedot/core/data/data.py
Outdated
|
||
@classmethod | ||
def from_dataframe(cls, | ||
df: pd.DataFrame, |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Про отдельные X и Y спорный момент. С одной стороны, мы идеологически предлагаем решение "из коробки" - вы просто читаете любой формат в DataFrame и засовываете в AutoML. С другой, почти любая предобработка данных пользователем выдаст X и Y отдельно.
Я считаю, этот вопрос можно переформулировать так: мы рассчитываем на продвинутого пользователя или наоборот?
Судя по тому, что дело дошло до создания InputData вручную, скорее на продвинутого. Тогда, на мой взгляд, разумнее использовать вариант с отдельными параметрами для X и Y.
UPD: На это можно посмотреть ещё так: в pandas гораздо интуитивнее разделяется датафрейм, чем два датафрейма сшиваются воедино. Гораздо лучше, если наш интерфейс не будет никого обрекать на конкатенацию датафреймов.
fedot/core/data/data.py
Outdated
@classmethod | ||
def from_numpy_time_series(cls, | ||
features_array: np.ndarray, | ||
target_array: np.ndarray, |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Было бы здорово сделать таргет по умолчанию None, И если он None, то features считаем равным таргет.
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Добавила
fedot/core/data/data.py
Outdated
|
||
Args: | ||
features_array: numpy array with features. | ||
target_array: numpy array with target. |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Мне как возможному пользователю может быть непонятно, что в федоте чаще всего фичи = таргет в инпут дате для задач прогнозирования.
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Чаще всего, но не всегда. Добавила пояснение в докстринг
Add InputData.from_dataframe and InputData.from_numpy methods. From dataframe expects that user already opend his df, set indeces, removed columns. From numpy based on exicting function.