Universal ExperimentAnalyzer

[maypink]

Universal ExperimentAnalyzer
All main features are described below

[aim-pep8-bot]

Hello @maypink! Thanks for updating this PR. We checked the lines you've touched for PEP 8 issues, and found:

There are currently no PEP 8 issues detected in this Pull Request. Cheers! 🍻

Comment last updated at 2023-09-12 08:04:13 UTC

[codecov-commenter]

Codecov Report

Merging #181 (6382a19) into main (147df93) will increase coverage by 0.00%.
Report is 5 commits behind head on main.
The diff coverage is 50.00%.

@@           Coverage Diff           @@
##             main     #181   +/-   ##
=======================================
  Coverage   74.10%   74.11%           
=======================================
  Files         129      129           
  Lines        7678     7688   +10     
=======================================
+ Hits         5690     5698    +8     
- Misses       1988     1990    +2     

Files Changed	Coverage Δ
golem/core/dag/graph.py	77.01% <ø> (ø)
golem/visualisation/opt_history/fitness_line.py	35.15% <0.00%> (ø)
golem/visualisation/graph_viz.py	63.15% <100.00%> (+0.12%)	⬆️

... and 6 files with indirect coverage changes

[nicl-nno]

Было бы здорово интегрировать возможность расчета стат. тестов для сравнения N историй оптимизации по разным критериям.

[maypink]

Тестирование статистической значимости

сейчас, мне кажется, это дело будет удобно использовать, когда у нас есть две выборки на сравнение и несколько тестов, на которые хочется проверить. в таком случае результат будет в следующем формате: два файла (или сколько угодно, в зависимости от заданного формата. но по классике один для pvalue, второй для statistic значений), каждый в таком формате

для сравнения большего количества выборок тоже можно использовать, все зависит от указанного теста. но энивэй методы analyze_metrics и analyze_convergence буквально вкладывают все необходимые данные в руки, в частной ситуации и самому будет просто написать какие угодно тесты

[maypink]

Структурная сложность

Структура сохранения следующая:

setup
         \
           dataset
                        \
                          здесь картинки

Удобно на это смотреть так, чтобы как минимум на глаз прикинуть стали ли решения принципиально другими

[maypink]

Сохранение таблиц с метриками

С помощью analyze_convergence и analyze_metrics можно сгенерировать таблицы с метриками.
Либо записать туда все значения, либо средние (если поставить is_mean в True).
Оба метода возвращают словари со всеми собранными значениями в указанном формате, так что дальше их можно передавать на статистическое тестирование

Формат таблиц такой:

[maypink]

График сходимости

С помощью plot_convergence можно рисовать графики сходимости с confidence interval и без

[nicl-nno]

Хорошо бы приложить скрипт с примером запуска. Можно пару тестовых историй для сравнения.

На картинках можно ещё приписать числом лучший фитнес. И указать в шапке, что это best in population.

[nicl-nno]

В идеале бы иметь возможность рисовать такие же графики не по фитнесу, а по отложенной выборке - но кажется это к GOLEM-у не особо применимо. Мб возможность кастомную метрику выводить.

[maypink]

Хорошо бы приложить скрипт с примером запуска. Можно пару тестовых историй для сравнения.

На картинках можно ещё приписать числом лучший фитнес. И указать в шапке, что это best in population.

пример добавила. пробросила заголовок, там еще пр в федоте для этого
.

можно указать несколько метрик, будет так

[nicl-nno]

Можно ещё реализовать опциальное закидывания историй в FEDOT.Web и вывод ссылки на визуализацию в конец лога.

[nicl-nno]

Ещё можно пример данных в zip или tar.gz закатать и распаковывать уже на месте.

[maypink]

Ещё можно пример данных в zip или tar.gz закатать и распаковывать уже на месте.

заархивировала и данные, и результаты. а с добавлением в FEDOT Web предлагаю разобраться на следующей итерации -- хочется уже влить и попользоваться