Implement pymatgen_read_from_file()

README.md

@@ -48,6 +48,7 @@ stk.plot3d(structure)
 * `stk.build.high_index_surface()`
 * `stk.build.get_high_index_surface_info()`
 * `stk.build.sqs_structures()`
+* `stk.build.pyxtal()`
 * `stk.build.B2()`
 * `stk.build.C14()`
 * `stk.build.C15()`
@@ -60,4 +61,11 @@ stk.plot3d(structure)
 ### Common 
 * `stk.common.ase_to_pymatgen()`
 * `stk.common.pymatgen_to_ase()`
+* `stk.common.pymatgen_read_from_file()`
 * `stk.common.ase_to_pyscal()`
+* `stk.common.apply_strain()`
+* `stk.common.center_coordinates_in_unit_cell()`
+* `stk.common.get_extended_positions()`
+* `stk.common.get_vertical_length()`
+* `stk.common.get_wrapped_coordinates()`
+* `stk.common.select_index()`

structuretoolkit/common/__init__.py

@@ -7,5 +7,9 @@
     get_wrapped_coordinates,
     select_index,
 )
-from structuretoolkit.common.pymatgen import ase_to_pymatgen, pymatgen_to_ase
+from structuretoolkit.common.pymatgen import (
+    ase_to_pymatgen,
+    pymatgen_read_from_file,
+    pymatgen_to_ase,
+)
 from structuretoolkit.common.pyscal import ase_to_pyscal

structuretoolkit/common/pymatgen.py

@@ -10,3 +10,9 @@ def pymatgen_to_ase(structure):
 
     adapter = AseAtomsAdaptor()
     return adapter.get_atoms(structure=structure)
+
+
+def pymatgen_read_from_file(*args, **kwargs):
+    from pymatgen.core import Structure
+
+    return pymatgen_to_ase(structure=Structure.from_file(*args, **kwargs))