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一个自定义填充化学式特征的即时软件

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一个自定义填充化学式特征的即时软件 使用说明:

声明:本软件为学术交流所用,运行密码为ICQMSicqms,不允许以任何形式用于商业用途,所有学术用户拥有使用权,欢迎加入AF,提出修改意见和一起完善。

①本软件写成简单实用的exe程序,不需要其他支持环境,可在Win系统上直接使用。 ②本软件为提取简单化学式特征使用,暂不支持-----”化学式中有括号,水合物符号,电子价等符号参与的化学式“若有特殊需求可联系作者,联系方式见控制台。 ③特征维度的限制为1000维度,维度是自己定制的(维度跟随你的特征文件),10000是每行最多的字符,可以使用我们提供的元素物理基本性质的特征文件,也可以自定义自己添加想要使用的特征。 ④元素物理基本性质的特征文件,以magpie.csv为例(mapie的参考文献https://www.nature.com/articles/npjcompumats201628) 在这个csv我们采集了magpie中给出的元素基本物理量,具体特征见magpe原文),请严格参照magpie.csv的文件输入格式,并在进行填充之前更正csv文件的名字为:Fillfeature.csv。 ⑤确保Fillfeature.csv(特征文件)和data.csv(要求里面只有化学式这一列,无其他多余字符)与exe软件处在同一个文件夹中。 ⑥运行软件,输入ICQMSicqms,得到out.csv文件,即提取化学式特征完成。 ⑦本软件产生的特征为加权求和标量版,即对化学式中的元素基本性质根据化学计量数进行求和,可仿照example中有输入案例,将exe复制入文件夹运行,得到out文件。 ⑧注意,当data.csv文件中出现了Fillfeature.csv没有的特征无法进行提取时,我们使用常见的填0的办法进行填充。 ⑨特征文件中的特征填充请使用数字,如有字符等,请先自行分类用数字进行表征。

关于Fillfeature.csv,这些csv文件是从其命名的软件包中提取出来的,首先,感谢他们的奉献。 在使用自定义Fillfeature.csv的时候,请务必严格按照magpie.csv的格式,在自定义的特征文件中不允许出现数字之外的符号,如有s,p,d电子轨道等特征,请自行对其变成数字上的表述。 欢迎联系,以完善ele仓库中可用的特征,联系方式为邮件,邮箱地址见软件控制台。

写在后面: 在S2.0版本中我们考虑了加入一些数学上的平均值,均差值还有物理上使用的约化质量概念等特征指示,如有其他需要添加和更新的性质将在后续版本中更新; 基于结构对特征采用独热编码的将仅制作在T(Tensor)版,该版本S(Scalar)版本,目标在于不考虑结构标量通用的描述符,T版本是为ABO3钙钛矿或者ABC型半哈斯勒等特定结构定制。 有想要做出ST(structure)版本的想法,功能为可以读取DFT计算输入文件POSCAR来提取结构上的环境信息,将Coulomb matrix,SOAP等作为输出文件,但这些都在S和T版本稳定后再做打算。

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